DNA甲基转移酶和TET酶
DNA甲基转移酶(DNMT)将甲基标记写入胞嘧啶,而TET(ten-eleven translocation)酶通过氧化5-甲基胞嘧啶启动其去除。它们共同构成了DNA甲基化的写入和擦除机制:DNMT3酶从头建立新的模式,DNMT1通过复制维持这些模式,而TET酶提供了一条主动去甲基化的途径。
Definition
DNA甲基转移酶是将甲基转移到胞嘧啶上以建立或维持DNA甲基化的酶,而TET酶是双加氧酶,将5-甲基胞嘧啶氧化为5-羟甲基胞嘧啶及其他产物,从而启动主动DNA去甲基化。
Scope
本条目涵盖了DNMT家族(从头与维持作用)和TET家族(5-甲基胞嘧啶向去甲基化的氧化),以及它们相互对立的活动如何设定和重置DNA甲基化模式。它属于参考教育性质,不提供治疗剂量或个体化建议。
Core questions
- 从头甲基转移酶和维持甲基转移酶在功能上有何不同?
- DNA复制后甲基化模式如何复制?
- TET酶如何启动胞嘧啶甲基化的去除?
- 什么是5-羟甲基胞嘧啶,它为何重要?
Key concepts
- DNMT1(维持性甲基转移酶)
- DNMT3A和DNMT3B(从头甲基转移酶)
- 半甲基化DNA识别
- TET1/TET2/TET3双加氧酶
- 5-羟甲基胞嘧啶
- 主动去甲基化与被动去甲基化
Mechanisms
DNMT3A和DNMT3B在发育过程中建立新的(从头)甲基化模式,将甲基从S-腺苷甲硫氨酸转移到先前未甲基化的胞嘧啶上;这些酶的缺失与正常的哺乳动物发育不相容。DNMT1作为维持酶,优先识别复制产生的半甲基化CpG位点并恢复对称甲基化,从而将模式复制到子细胞。TET酶(TET1、TET2、TET3)将5-甲基胞嘧啶氧化为5-羟甲基胞嘧啶并进一步氧化为其他氧化碱基;这些碱基可以通过碱基切除修复被移除并替换为未修饰的胞嘧啶,从而提供主动去甲基化途径,而复制过程中未能维持甲基化则会导致被动去甲基化。相互对立的写入和擦除活动共同使DNA甲基化成为一个动态的、可重置的标记。
Clinical relevance
DNMT和TET基因在血液系统恶性肿瘤和其他恶性肿瘤中反复发生改变,并被研究作为药物靶点,它们的活性塑造了表观基因组研究中解释的甲基化组。本条目描述了它们的分子作用作为参考资料,并非个体诊断或治疗的依据。
Evidence & guidelines
DNMT从头和维持分工由Okano及其同事确立,TET酶的去甲基化功能由Tahiliani及其同事对5-羟甲基胞嘧啶产生的鉴定所揭示,并由Ito及其同事证实。Bird以及Smith和Meissner的综述将这些酶整合到更广泛的甲基化循环中;TET驱动的去甲基化在特定背景下的机制细节仍在不断完善。
History
维持性甲基转移酶的概念早在酶的分子鉴定之前就已存在;20世纪90年代DNMT1以及随后的DNMT3从头酶的克隆定义了写入机制。甲基化如何被主动擦除的长期难题从2009年开始得到解决,当时TET1被证明可以将5-甲基胞嘧啶氧化为5-羟甲基胞嘧啶,揭示了一种酶促去甲基化途径和基因组中一种新的修饰碱基。
Key figures
- En Li
- Masaki Okano
- Anjana Rao
- Mamta Tahiliani
- Yi Zhang
Related topics
Seminal works
- okano-1999
- tahiliani-2009
- ito-2010
Frequently asked questions
- 从头甲基转移酶和维持甲基转移酶有什么区别?
- 从头酶(DNMT3A和DNMT3B)将甲基添加到先前未甲基化的胞嘧啶上以建立新模式,而维持酶(DNMT1)在DNA复制后将现有甲基化复制到新链上。
- TET酶如何去除DNA甲基化?
- TET酶将5-甲基胞嘧啶氧化为5-羟甲基胞嘧啶和进一步氧化的形式;这些可以被修复回未修饰的胞嘧啶,从而提供主动去甲基化途径,或者如果在复制过程中未能维持,甲基化可能会被动丢失。
Methods for this concept
- Time-series Epigenome-wide Association Study
- Differential Epigenome-Wide Association Study
- Epigenome-wide association study in educational research
- Epigenome-wide association study
- ATAC-seq Analysis
- Bayesian epigenome-wide association study in educational research
- Multi-omics epigenome-wide association study
- Machine learning-assisted epigenome-wide association study