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时间序列微生物组多样性分析 — 纵向微生物组多样性分析
时间序列微生物组多样性分析追踪微生物群落的丰富度、均匀度和群落组成在同一受试者多个时间点上的变化。通过将标准多样性指标与纵向统计模型相结合，它可以区分真实的的时间动态与个体间的变异，识别饮食改变、抗生素治疗或疾病发作等扰动何时以及如何重塑微生物组。
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来源
- Callahan, B. J., McMurdie, P. J., Rosen, M. J., Han, A. W., Johnson, A. J. A., & Holmes, S. P. (2016). DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data. Nature Methods, 13(7), 581–583. DOI: 10.1038/nmeth.3869 ↗
- Chen, Y., Lun, A. T. L., & Smyth, G. K. (2023). Differential abundance testing on single-cell data using quasi-likelihood methods. Genome Biology, 24(1), 188. link ↗
如何引用本页
ScholarGate. (2026, June 3). Longitudinal Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/zh/bioinformatics/time-series-microbiome-diversity-analysis
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- 多组学微生物多样性分析生物信息学↔ 比较
- 通路富集分析生物信息学↔ 比较
- RNA-seq差异表达生物信息学↔ 比较
- Single-cell RNA-seq analysis生物信息学↔ 比较
- 时间序列 RNA-seq 差异表达生物信息学↔ 比较
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