贝叶斯微生物组多样性分析 — 群落结构的概率评估

贝叶斯微生物组多样性分析将概率模型（主要是Dirichlet-Multinomial及其相关的分层框架）应用于16S rRNA或鸟枪法宏基因组计数数据，以估计alpha多样性（样本内丰富度和均匀度）和beta多样性（样本间组成差异），同时在整个推断链中传播不确定性。与基于频率学抽样（rarefaction）的方法不同，贝叶斯方法将分类群计数视为来自潜在组成的抽样，从而能够在多样性指标上获得可信区间，并对测序深度不等的组进行有原则的比较。