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基于网络的微生物组多样性分析

基于网络的微生物组多样性分析将图论共现网络推断与经典的α-和β-多样性指标相结合，以表征微生物群落的结构组织。该方法不将分类单元视为独立的实体，而是将成对的微生物关联建模为网络中的边，从而能够识别简单的多样性指数无法检测到的关键分类单元、群落模块和生态相互作用模式。

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基于网络的微生物组多样性分析

基因集富集分析 (GSEA)基于网络的通路富集分析通路富集分析系统发育分析 RNA-seq差异表达贝叶斯微生物组多样性分析多组学微生物多样性分析

来源

Friedman, J., & Alm, E. J. (2012). Inferring correlation networks from genomic survey data. PLoS Computational Biology, 8(9), e1002687. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1002687 ↗
Faust, K., & Raes, J. (2012). Microbial interactions: from networks to models. Nature Reviews Microbiology, 10(8), 538–550. DOI: 10.1038/nrmicro2832 ↗

如何引用本页

ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/zh/bioinformatics/network-based-microbiome-diversity-analysis

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