РНК-швидкість
РНК-швидкість – це обчислювальний метод, який дозволяє визначити майбутній стан розвитку окремих клітин на основі даних одноклітинного РНК-секвенування. Розроблений Ла Манно та колегами у 2018 році, аналіз РНК-швидкості вимірює напрямок та темп переходу клітинних станів шляхом аналізу співвідношення несплайсованих до сплайсованих транскриптів мРНК в окремих клітинах. Це дозволяє прогнозувати клітинні траєкторії та шляхи диференціації без необхідності тимчасового відбору проб або маніпуляцій, надаючи унікальні відомості про рішення щодо долі клітин під час розвитку та хвороби.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Карта методів
Околиця споріднених методів — виберіть вузол, щоб дослідити.
Джерела
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., & Merad, M. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7737), 494–498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
- Bergen, V., Lange, M., Peidli, S., Wolf, F. A., & Raj, B. (2020). Generalizing RNA velocity to transient cell states through smoothed differentiation of expected counts. Nature Biotechnology, 38(12), 1408–1417. DOI: 10.1038/s41587-020-0591-3 ↗
- Chen, H., & Albergante, L. (2022). scVelo: RNA velocity at single-cell resolution. bioRxiv. link ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). RNA Velocity for Single-Cell Trajectory Inference. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/genetics/rna-velocity
Який метод?
Поставте цей метод поруч із його найближчими спорідненими й читайте їх пліч-о-пліч — бібліотека викладає книги на стіл; вибір за вами.
- Аналіз ATAC-seqГенетика↔ порівняти
- Аналіз Hi-CГенетика↔ порівняти
Згадується в
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →