ScholarGate
ผู้ช่วย

เปรียบเทียบวิธี

ดูวิธีที่เลือกเทียบกันแบบเคียงข้าง แถวที่ต่างกันจะถูกเน้นไว้

การวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนาในเซลล์เดี่ยว×การระบุความแปรผัน×
สาขาวิชาชีวสารสนเทศศาสตร์ชีวสารสนเทศศาสตร์
ตระกูลProcess / pipelineProcess / pipeline
ปีกำเนิด2011–20152009–2010 (modern high-throughput era)
ผู้ริเริ่มNavin et al. (single-cell sequencing for CNV); Garvin et al. (Ginkgo tool, 2015)Li et al. (SAMtools/bcftools, 2009); McKenna et al. (GATK, 2010)
ประเภทComputational genomics pipelineComputational genomics pipeline
แหล่งต้นตำรับGarvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link ↗McKenna, A., Hanna, M., Banks, E., Sivachenko, A., Cibulskis, K., Kernytsky, A., ... & DePristo, M. A. (2010). The Genome Analysis Toolkit: A MapReduce framework for analyzing next-generation DNA sequencing data. Genome Research, 20(9), 1297–1303. DOI ↗
ชื่อเรียกอื่นscCNV analysis, single-cell CNV, scCNA analysis, single-cell copy number aberration analysisSNP calling, genotyping from sequencing, mutation detection, variant detection
ที่เกี่ยวข้อง66
สรุปSingle-cell copy number variation (scCNV) analysis detects gains and losses of genomic segments within individual cells, enabling researchers to resolve intratumor heterogeneity, reconstruct clonal evolution, and distinguish malignant from normal cells at single-cell resolution. It can be applied to single-cell whole-genome sequencing data directly or inferred from read-depth signals in scRNA-seq or scATAC-seq experiments.Variant calling is the computational process of identifying positions in a sequenced genome that differ from a reference sequence — including single nucleotide polymorphisms (SNPs), small insertions and deletions (indels), and structural variants. It transforms aligned sequencing reads into an interpretable catalogue of genetic differences, forming the foundation for population genetics, disease-gene discovery, and clinical genomics applications.
ScholarGateชุดข้อมูล
  1. v1
  2. 2 แหล่งอ้างอิง
  3. PUBLISHED
  1. v1
  2. 2 แหล่งอ้างอิง
  3. PUBLISHED

ไปที่หน้าค้นหา ดาวน์โหลดสไลด์

ScholarGateเปรียบเทียบวิธี: Single-cell Copy Number Variation Analysis · Variant Calling. สืบค้นเมื่อ 2026-06-18 จาก https://scholargate.app/th/compare