Detecção e Caracterização da Resistência Antimicrobiana
A detecção e caracterização da resistência antimicrobiana é a área da microbiologia diagnóstica que se ocupa de determinar se um microrganismo é suscetível ou resistente a agentes antimicrobianos e de identificar os mecanismos responsáveis. Abrange métodos fenotípicos que medem o crescimento na presença do fármaco, ensaios direcionados que sinalizam fenótipos de resistência específicos e métodos moleculares que detectam os genes e mutações de resistência subjacentes.
Definition
A determinação laboratorial sistemática da resposta de um organismo a agentes antimicrobianos e dos mecanismos genéticos e bioquímicos subjacentes a qualquer suscetibilidade reduzida, utilizando métodos fenotípicos e moleculares interpretados em relação a pontos de corte padronizados.
Scope
Esta área orienta o leitor através de três abordagens complementares: testes padronizados de suscetibilidade antimicrobiana que resultam em uma interpretação suscetível-intermediário-resistente, detecção fenotípica de padrões de resistência clinicamente importantes, como a produção de beta-lactamase, e detecção molecular de determinantes de resistência. Ela enquadra como os laboratórios geram os dados de suscetibilidade usados no cuidado ao paciente, vigilância e gestão, sem oferecer instruções de tratamento.
Sub-topics
Core questions
- Este organismo é suscetível ou resistente a um determinado agente antimicrobiano, e como esse julgamento é padronizado?
- Qual fenótipo de resistência está presente e qual mecanismo o explica?
- Quais genes ou mutações de resistência são detectáveis e como o genótipo e o fenótipo se relacionam?
Key concepts
- Concentração inibitória mínima (CIM)
- Pontos de corte clínicos e interpretação S-I-R
- Detecção fenotípica versus genotípica
- Produção de beta-lactamase e carbapenemase
- Genes de resistência adquiridos e mutações cromossômicas
- Concordância genótipo-fenótipo
- Padronização (CLSI, EUCAST)
Mechanisms
Os métodos fenotípicos expõem um inóculo padronizado do organismo a concentrações antimicrobianas definidas e leem a inibição do crescimento, resumida como uma CIM ou diâmetro de halo e interpretada em relação a pontos de corte estabelecidos por organismos de padronização como CLSI e EUCAST (jorgensen-2009; clsi-m100). Ensaios fenotípicos direcionados detectam uma característica de resistência específica, por exemplo, a hidrólise de um beta-lactâmico por uma beta-lactamase. Os métodos moleculares, por sua vez, detectam o determinante genético diretamente, identificando genes de resistência adquiridos ou mutações associadas à resistência; o sequenciamento de genoma completo permite cada vez mais uma caracterização abrangente, embora a previsão genótipo-fenótipo permaneça imperfeita (ellington-2017). Regras de especialistas codificam relações conhecidas entre mecanismos e suscetibilidade esperada para melhorar a interpretação e sinalizar resultados inconsistentes (leclercq-2013).
Clinical relevance
A caracterização da suscetibilidade e resistência sustenta as evidências usadas no manejo de doenças infecciosas, gestão de antimicrobianos, controle de infecções e vigilância da resistência. Como área de referência, descreve como os laboratórios produzem e interpretam esses dados; não fornece orientação diagnóstica ou de prescrição para pacientes individuais.
Epidemiology
Testes padronizados de suscetibilidade e caracterização da resistência geram os dados que alimentam antibiogramas locais e sistemas de vigilância nacionais e internacionais, que rastreiam o surgimento e a disseminação de organismos resistentes e mecanismos de resistência ao longo do tempo.
History
Os testes de suscetibilidade antimicrobiana desenvolveram-se juntamente com a era dos antibióticos de meados do século XX, com os métodos de difusão e diluição sendo padronizados por organismos como CLSI e EUCAST. Nas décadas subsequentes, o campo adicionou testes fenotípicos direcionados para mecanismos de resistência emergentes e, mais recentemente, detecção molecular e baseada em sequenciamento de determinantes de resistência (jorgensen-2009; ellington-2017).
Debates
- Até que ponto o genótipo pode substituir o fenótipo?
- Métodos moleculares e de sequenciamento detectam determinantes de resistência rapidamente, mas nem sempre preveem o fenótipo de forma confiável; a extensão em que a previsão genotípica pode substituir os testes de suscetibilidade fenotípica permanece uma questão ativa.
Related topics
Seminal works
- jorgensen-2009
- leclercq-2013
- ellington-2017
Frequently asked questions
- Qual a diferença entre detectar resistência fenotipicamente e molecularmente?
- Métodos fenotípicos observam se o organismo cresce na presença de um fármaco ou expressa uma característica de resistência específica, enquanto métodos moleculares detectam o gene ou mutação de resistência diretamente; os dois são complementares e nem sempre concordam.
- Por que são necessários pontos de corte padronizados?
- Pontos de corte de organismos de padronização como CLSI e EUCAST traduzem uma CIM ou diâmetro de halo medido em uma categoria suscetível, intermediário ou resistente, para que os resultados sejam comparáveis entre laboratórios.