Frequência Alélica e Frequência Genotípica

A frequência alélica é a proporção de um alelo particular entre todos os alelos em um lócus em uma população, e a frequência genotípica é a proporção de indivíduos que carregam uma combinação particular de alelos. Juntas, essas duas quantidades são as medidas descritivas básicas da composição genética de uma população e as variáveis sobre as quais todas as forças evolutivas atuam.

Definition

Frequência alélica é a proporção relativa de um dado alelo entre todas as cópias em um lócus em uma população; frequência genotípica é a proporção de indivíduos na população que carregam um genótipo especificado naquele lócus.

Scope

A entrada define as duas medidas de frequência, mostra como cada uma é contada a partir de dados genotípicos e explica a relação entre elas sob acasalamento aleatório. Também observa como os dados de frequência alélica são organizados em bancos de dados de referência populacional. É um tópico conceitual e metodológico, não uma orientação clínica.

Core questions

• Como as frequências alélicas são contadas a partir das contagens genotípicas observadas?
• Como as frequências alélicas e genotípicas se relacionam sob acasalamento aleatório?
• Como os bancos de dados de referência populacional relatam as frequências alélicas e por que elas diferem entre as populações?

Key concepts

• Frequência alélica
• Frequência genotípica
• Contagem de alelos a partir de genótipos
• Frequência do alelo menor
• Polimorfismo versus variante rara
• Frequências de referência específicas da população

Mechanisms

As frequências alélicas são obtidas contando as cópias de alelos em todos os indivíduos amostrados e dividindo pelo número total de cópias; para um lócus bialélico, as duas frequências alélicas somam um. As frequências genotípicas são as proporções de cada genótipo entre os indivíduos. Sob acasalamento aleatório, esses dois conjuntos de números estão ligados pela relação de Hardy-Weinberg, de modo que as frequências genotípicas podem ser previstas a partir das frequências alélicas, e as frequências alélicas de uma amostra podem ser recuperadas a partir de suas contagens genotípicas. As forças evolutivas alteram a composição de uma população precisamente ao modificar essas frequências.

Clinical relevance

As frequências alélicas populacionais são centrais para a interpretação de variantes genéticas: uma variante comum em uma população de referência correspondente é geralmente menos provável de ser a causa de uma doença rara, e as estimativas de frequência de portadores derivam diretamente das frequências alélicas. Essas medidas descrevem como a variação é catalogada e ponderada como evidência; elas não são, por si só, uma base para diagnóstico ou tratamento individual.

Epidemiology

As frequências alélicas variam entre as populações humanas como resultado de suas histórias demográficas, portanto, grandes catálogos como o Projeto 1000 Genomas relatam frequências estratificadas por população para apoiar a interpretação da variação correspondente à população.

Evidence & guidelines

Recursos de referência populacional, como o Projeto 1000 Genomas, fornecem dados de frequência alélica em muitas populações que são amplamente utilizados como linha de base para avaliar a raridade de variantes genéticas.

History

A contagem de alelos e genótipos tornou-se significativa uma vez que a herança mendeliana foi enquadrada em termos populacionais no início do século XX. O princípio de Hardy-Weinberg explicitou como as frequências genotípicas se relacionam com as frequências alélicas, e o desenvolvimento posterior de marcadores moleculares e, finalmente, grandes consórcios de sequenciamento transformaram a estimativa da frequência alélica em uma medição rotineira em escala populacional.

Key figures

• G. H. Hardy
• Wilhelm Weinberg
• Sewall Wright

Seminal works

• hardy-1908
• 1000genomes-2015

Frequently asked questions

Qual é a diferença entre frequência alélica e frequência genotípica?

A frequência alélica conta cópias de um alelo em relação a todos os alelos em um lócus, enquanto a frequência genotípica conta indivíduos que carregam uma combinação alélica particular. Sob acasalamento aleatório, as duas estão ligadas pela relação de Hardy-Weinberg.

Por que as frequências alélicas diferem entre as populações?

Porque as populações têm diferentes histórias demográficas — efeitos fundadores, gargalos, deriva, migração e seleção local — que moldam quais alelos se tornaram comuns ou raros, razão pela qual os bancos de dados de referência relatam as frequências separadamente por população.