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時系列系統解析 — 時間的系統発生学
時系列系統解析は、既知の時間点からサンプリングされた配列を用いて、生物または遺伝子変異体の進化史を再構築する。サンプリング日を直接モデルに組み込むことで、分岐時間、置換率、および祖先関係を絶対時間スケールで推定する。これはウイルスの流行、古代DNAの動態、および急速な微生物進化の研究に不可欠である。
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出典
- Drummond, A. J., & Rambaut, A. (2007). BEAST: Bayesian evolutionary analysis by sampling trees. BMC Evolutionary Biology, 7, 214. DOI: 10.1186/1471-2148-7-214 ↗
- Bouckaert, R., Vaughan, T. G., Barido-Sottani, J., Duchene, S., Fourment, M., Gavryushkina, A., et al. (2019). BEAST 2.5: An advanced software platform for Bayesian evolutionary analysis. PLOS Computational Biology, 15(4), e1006650. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1006650 ↗
このページの引用方法
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Phylogenetic Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/time-series-phylogenetic-analysis
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