Pengujian Farmakogenomik dan Implementasi Klinis

Pengujian farmakogenomik mengukur varian genetik pasien dalam gen yang relevan dengan respons obat, dan implementasi klinis adalah upaya untuk mengubah hasil tersebut menjadi informasi yang dapat digunakan pada saat peresepan. Topik ini mencakup bagaimana tes farmakogenomik dilakukan dan dilaporkan, bagaimana hasil diterjemahkan ke dalam fenotipe yang diprediksi, dan apa yang diperlukan untuk menyampaikan informasi tersebut secara andal dalam sistem kesehatan.

Definition

Pengujian farmakogenomik adalah penentuan genotipe individu untuk farmakogen secara laboratorium; implementasi klinis adalah serangkaian proses — interpretasi, pemetaan pedoman, dukungan keputusan, dan penyampaian — yang membuat hasil tersebut dapat ditindaklanjuti dalam perawatan rutin.

Scope

Entri ini mencakup metode diagnostik molekuler yang digunakan untuk pengujian farmakogenomik, perbedaan antara pengujian reaktif (gen tunggal, sesuai permintaan) dan pre-emptive (panel, hasil disimpan sebelum dibutuhkan), penerjemahan genotipe ke fenotipe dan rekomendasi klinis, serta infrastruktur implementasi seperti dukungan keputusan klinis. Ini adalah tinjauan referensi dan tidak mengarahkan pengujian atau peresepan untuk individu.

Core questions

• Bagaimana varian farmakogenomik diukur dan dilaporkan?
• Kapan pengujian reaktif lebih baik daripada pengujian panel pre-emptive?
• Bagaimana genotipe diterjemahkan menjadi fenotipe dan rekomendasi peresepan?
• Infrastruktur apa yang dibutuhkan untuk menyampaikan hasil di titik perawatan?

Key concepts

• Uji genotipe versus sekuensing
• Panel varian bertarget
• Pengujian reaktif versus pre-emptive (panel)
• Tabel terjemahan genotipe-ke-fenotipe
• Integrasi dukungan keputusan klinis
• Portabilitas hasil dan standar pelaporan
• Validitas tes dan utilitas klinis

Mechanisms

Sebagian besar tes farmakogenomik menginterogasi serangkaian varian yang diketahui dengan genotipe bertarget, meskipun sekuensing yang lebih luas semakin banyak digunakan; hasilnya umumnya dilaporkan sebagai diplotipe dan metabolisme yang disimpulkan atau fenotipe fungsional. Implementasi menghubungkan fenotipe tersebut dengan rekomendasi pedoman yang ditinjau oleh rekan sejawat dan, dalam sistem yang matang, menampilkannya melalui dukungan keputusan klinis elektronik sehingga informasi tersebut mencapai dokter penulis resep ketika obat yang relevan dipesan. Karena genotipe stabil sepanjang hidup seseorang, pengujian panel pre-emptive menyimpan hasil untuk penggunaan di masa mendatang, sedangkan pengujian reaktif menangani keputusan obat tunggal pada saat muncul (Swen et al., 2011; Wang, McLeod & Weinshilboum, 2011).

Clinical relevance

Pengujian dan implementasi yang efektif menentukan apakah pengetahuan farmakogenomik benar-benar sampai ke pasien, dan memahami persyaratannya adalah hal utama bagi farmakologi klinis dan kedokteran laboratorium. Entri ini menjelaskan bagaimana pengujian dan implementasi bekerja sebagai bahan referensi; ini bukan rekomendasi untuk menguji atau mengubah terapi untuk pasien tertentu.

Epidemiology

Karena varian yang relevan secara klinis umum, pengujian panel pre-emptive biasanya menghasilkan setidaknya satu hasil yang dapat ditindaklanjuti untuk sebagian besar individu yang diuji, yang merupakan bagian dari alasan yang diajukan untuk pendekatan berbasis panel; namun, penerimaan dan ketersediaan dukungan keputusan sangat bervariasi di seluruh sistem kesehatan (Wang, McLeod & Weinshilboum, 2011).

Evidence & guidelines

Implementasi didasarkan pada konsorsium penghasil pedoman — terutama Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC) dan Dutch Pharmacogenetics Working Group (DPWG) — yang menerjemahkan genotipe ke dalam rekomendasi peresepan berjenjang, dan oleh basis pengetahuan yang dikurasi seperti PharmGKB; regulator juga memasukkan informasi farmakogenomik ke dalam label obat (Swen et al., 2011; Lee et al., 2022; Hicks et al., 2015).

History

Tes farmakogenetik gen tunggal mulai dipraktikkan untuk obat-obatan tertentu sejak akhir abad kedua puluh. Pengembangan pedoman genotipe-ke-fenotipe standar oleh CPIC dan DPWG, bersama dengan rekam medis elektronik dan dukungan keputusan, mengalihkan perhatian dari tes terisolasi ke program implementasi yang sistematis, seringkali pre-emptive, pada tahun 2010-an.

Debates

Pengujian gen tunggal reaktif versus pengujian panel pre-emptive

Panel pre-emptive menawarkan hasil segera ketika obat diresepkan kemudian tetapi memerlukan infrastruktur untuk menyimpan dan menampilkan kembali hasil, sementara pengujian reaktif lebih sederhana per episode; keseimbangan biaya, utilitas, dan kelayakan masih diperdebatkan.

Mendemonstrasikan utilitas klinis

Para kritikus mencatat bahwa validitas analitik sudah mapan untuk banyak uji, tetapi bukti berkualitas tinggi bahwa pengujian meningkatkan hasil klinis lebih kuat untuk beberapa pasangan gen-obat daripada yang lain, membentuk ketidaksepakatan tentang tes mana yang menjamin penggunaan rutin.

Key figures

• Jesse Swen
• Kelly Caudle
• Mary Relling
• Teri Klein
• Howard McLeod

Seminal works

• swen-2011
• hicks-2015
• lee-2022

Frequently asked questions

Apa perbedaan antara pengujian farmakogenomik reaktif dan pre-emptive?

Pengujian reaktif dipesan untuk keputusan obat tertentu pada saat muncul, sedangkan pengujian pre-emptive menggenotipe panel terlebih dahulu dan menyimpan hasilnya sehingga tersedia kapan pun obat yang relevan dipertimbangkan kemudian.

Mengapa dukungan keputusan klinis ditekankan dalam implementasi?

Karena genotipe yang tersimpan hanya berguna jika interpretasi yang tepat mencapai dokter penulis resep pada waktu yang tepat; menyematkan peringatan dan rekomendasi dalam rekam medis elektronik adalah cara banyak program menyampaikan informasi tersebut di titik perawatan.