Apa perbedaan antara pengujian farmakogenetik dan farmakogenomik?

Farmakogenetika secara historis mengacu pada hubungan gen-obat tunggal sementara farmakogenomika mencakup pengaruh seluruh genom pada respons obat; dalam implementasi klinis, istilah-istilah tersebut sekarang sebagian besar digunakan secara bergantian untuk pengujian yang memprediksi respons obat dari variasi genetik.

Apakah tes farmakogenomik memberi tahu klinisi secara persis apa yang harus diresepkan?

Tidak. Sebuah tes melaporkan fenotipe yang diprediksi; mengubahnya menjadi keputusan peresepan bergantung pada pedoman berbasis bukti dan penilaian klinis yang mempertimbangkan keseluruhan pasien, dan hasil tes saja bukanlah instruksi pengobatan.

Pengujian Farmakogenomik dan Implementasi Klinis

Pengujian farmakogenomik dan implementasi klinis merupakan sisi terapan dari farmakogenomik: bagaimana variasi genetik yang diwariskan dalam gen penanganan obat dan gen target obat diukur dalam sampel pasien, diterjemahkan menjadi fenotipe respons obat yang diprediksi, dan disampaikan kepada klinisi dalam bentuk yang dapat digunakan. Ini mencakup teknologi laboratorium yang mendeteksi varian, kerangka kerja bukti yang memutuskan pasangan gen-obat mana yang dapat ditindaklanjuti, model untuk kapan harus melakukan pengujian, standar untuk pelaporan hasil, dan sistem elektronik yang menyajikan panduan pada titik peresepan.

Temukan Topik dengan PaperMindSegeraFind papers & topics

Tools & resources

Unduh salindia

Learn & explore

VideoSegera

Definition

Pengujian farmakogenomik dan implementasi klinis adalah serangkaian proses laboratorium, interpretatif, dan informatika di mana variasi genetik yang memengaruhi respons obat dideteksi, diklasifikasikan ke dalam fenotipe, dilaporkan, dan diintegrasikan ke dalam alur kerja klinis untuk menginformasikan keputusan peresepan.

Scope

Area ini mengarahkan pembaca pada jalur menyeluruh dari tes genetik hingga tindakan klinis. Ini memperkenalkan teknologi genotipe dan sekuensing yang digunakan di laboratorium farmakogenomik, kerangka kerja pedoman dan tingkat bukti (terutama dari Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium), pilihan strategis antara pengujian pre-emptive dan reaktif, interpretasi dan pelaporan hasil yang terstandardisasi, serta sistem pendukung keputusan klinis yang menyematkan peringatan farmakogenomik dalam rekam medis elektronik. Ini memperlakukan topik-topik ini sebagai topik referensi dalam ilmu implementasi dan kedokteran laboratorium, bukan sebagai instruksi klinis.

Sub-topics

Core questions

Bagaimana variasi genetik dalam farmakogen dideteksi, dan apa yang ditangkap atau dilewatkan oleh teknologi yang berbeda?
Pasangan gen-obat mana yang memiliki bukti yang cukup untuk dapat ditindaklanjuti secara klinis, dan siapa yang memutuskan?
Haruskah genotipe dilakukan secara pre-emptive di seluruh populasi atau secara reaktif pada saat obat dipertimbangkan?
Bagaimana genotipe mentah diterjemahkan ke dalam fenotipe standar dan dikomunikasikan dalam laporan klinis?
Bagaimana panduan farmakogenomik dapat disampaikan secara andal kepada dokter tanpa kelelahan peringatan?

Key concepts

Tindakan pasangan gen-obat
Terjemahan genotipe ke fenotipe
Nomenklatur alel bintang (*)
Pengujian pre-emptive versus reaktif
Dukungan keputusan klinis dan rekam medis elektronik
Tingkat bukti dan kekuatan pedoman
Terminologi hasil standar

Mechanisms

Implementasi mengikuti alur. Sebuah laboratorium mendeteksi varian dalam farmakogen menggunakan array genotipe atau sekuensing yang ditargetkan; alel yang terdeteksi dinamai menggunakan nomenklatur alel bintang dan digabungkan menjadi diplotipe. Diplotipe diterjemahkan menjadi fenotipe metabolizer atau respons yang diprediksi menggunakan aturan konsensus. Kerangka kerja bukti seperti yang dari Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium mengevaluasi pasangan gen-obat mana yang memiliki cukup bukti untuk dapat ditindaklanjuti dan menerbitkan panduan tentang bagaimana fenotipe tertentu berhubungan dengan respons obat. Hasilnya dilaporkan dengan istilah standar dan, semakin sering, disimpan dalam rekam medis elektronik sehingga dukungan keputusan klinis dapat menyajikan panduan yang relevan ketika obat yang terpengaruh diresepkan (Roden, 2019; Relling & Klein, 2011; Relling et al., 2019).

Clinical relevance

Implementasi farmakogenomik menjelaskan infrastruktur di mana informasi genetik tentang respons obat dapat mencapai perawatan klinis; memahaminya membantu klinisi, laboran, dan informatis menilai apa yang dapat dan tidak dapat didukung oleh laporan farmakogenomik. Topik-topik di sini mengkarakterisasi bagaimana bukti dan hasil dihasilkan, distandarisasi, dan disampaikan, dan dimaksudkan sebagai orientasi referensi daripada sebagai sumber keputusan peresepan atau dosis individual.

Evidence & guidelines

Kerangka kerja bukti yang dominan di bidang ini adalah Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC), yang menilai kekuatan bukti gen-obat dan mengeluarkan pedoman yang ditinjau sejawat yang menjelaskan bagaimana bertindak berdasarkan genotipe yang telah ditetapkan; Dutch Pharmacogenetics Working Group menyediakan kerangka kerja Eropa paralel (Relling & Klein, 2011; Relling et al., 2019). Program prospektif besar seperti proyek Vanderbilt PREDICT menunjukkan model operasional untuk menyematkan genotipe dan dukungan keputusan ke dalam perawatan rutin (Pulley et al., 2012). Kerangka kerja ini menjelaskan bukti dan proses; mereka tidak menggantikan penilaian klinis.

History

Implementasi farmakogenomik berkembang dari puluhan tahun penelitian farmakogenetika menjadi disiplin klinis yang terorganisir pada tahun 2010-an. Pendirian Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium pada tahun 2009 menyediakan kerangka kerja bersama untuk mengubah asosiasi gen-obat menjadi pedoman yang dapat ditindaklanjuti (Relling & Klein, 2011), dan program institusional awal seperti proyek PREDICT Vanderbilt menunjukkan bagaimana genotipe prospektif dan dukungan keputusan elektronik dapat dioperasionalkan (Pulley et al., 2012). Satu dekade kemudian, bidang ini telah berkembang menjadi ilmu implementasi yang dapat dikenali dengan terminologi standar dan integrasi rekam medis elektronik yang berkembang (Relling et al., 2019; Roden, 2019).

Debates

Pengujian pre-emptive versus reaktif: Apakah akan melakukan genotipe pasien terlebih dahulu sehingga hasilnya tersedia sebelum obat diresepkan, atau hanya menguji secara reaktif ketika obat tertentu sedang dipertimbangkan, melibatkan pertukaran dalam biaya, kesiapan data, dan hasil klinis yang masih aktif diperdebatkan.

Key figures

Mary V. Relling
Teri E. Klein
Dan M. Roden
Kelly E. Caudle
Josh F. Peterson

Seminal works

relling-2011
pulley-2012
relling-2019
roden-2019

Frequently asked questions

Apa perbedaan antara pengujian farmakogenetik dan farmakogenomik?: Farmakogenetika secara historis mengacu pada hubungan gen-obat tunggal sementara farmakogenomika mencakup pengaruh seluruh genom pada respons obat; dalam implementasi klinis, istilah-istilah tersebut sekarang sebagian besar digunakan secara bergantian untuk pengujian yang memprediksi respons obat dari variasi genetik.
Apakah tes farmakogenomik memberi tahu klinisi secara persis apa yang harus diresepkan?: Tidak. Sebuah tes melaporkan fenotipe yang diprediksi; mengubahnya menjadi keputusan peresepan bergantung pada pedoman berbasis bukti dan penilaian klinis yang mempertimbangkan keseluruhan pasien, dan hasil tes saja bukanlah instruksi pengobatan.