क्यूटीएल (QTL) और जटिल लक्षण मानचित्रण

एक निरंतर भिन्न होने वाले लक्षण को प्रभावित करने वाले विशिष्ट जीनोमिक क्षेत्रों का पता लगाना, मात्रात्मक आनुवंशिकी की अमूर्त आनुवंशिकता को ठोस मानचित्र स्थितियों में बदल देता है, जिसमें या तो नियंत्रित क्रॉस या जनसंख्या-स्तरीय जुड़ाव का उपयोग किया जाता है।

Definition

क्यूटीएल (QTL) और जटिल लक्षण मानचित्रण उन विधियों का समूह है जो व्यक्तियों में आनुवंशिक मार्करों और लक्षण के बीच सांख्यिकीय जुड़ाव का पता लगाकर एक मात्रात्मक या जटिल लक्षण में योगदान करने वाले जीनोमिक क्षेत्रों या वेरिएंट का पता लगाते हैं।

Scope

यह विषय मार्कर और लक्षण मानों के बीच लिंकेज के माध्यम से प्रायोगिक क्रॉस में मात्रात्मक लक्षण लोकस (QTL) मानचित्रण, अंतराल मानचित्रण और एलओडी (LOD) स्कोर, सघन आणविक मार्करों की ओर बढ़ना, आउटब्रेड आबादी में जीनोम-व्यापी जुड़ाव अध्ययन (GWAS), लिंकेज डिसइक्विलिब्रियम और जुड़ाव में इसकी भूमिका, और जनसंख्या संरचना के भ्रमित करने वाले प्रभाव और इसे कैसे नियंत्रित किया जाता है, को शामिल करता है। यह जटिल लक्षणों के अंतर्निहित लोकी के स्थानीयकरण का वर्णन करता है; भिन्नता का सांख्यिकीय विवरण आसन्न विषय में शामिल है।

Core questions

• एक मार्कर और एक लक्षण के बीच लिंकेज एक क्रॉस में एक मात्रात्मक लक्षण लोकस को कैसे प्रकट करता है?
• जीनोम-व्यापी जुड़ाव अध्ययन आबादी में लक्षण-जुड़े वेरिएंट का पता कैसे लगाते हैं?
• लिंकेज डिसइक्विलिब्रियम जुड़ाव मानचित्रण के लिए केंद्रीय क्यों है?
• अज्ञात जनसंख्या संरचना गलत जुड़ाव कैसे पैदा करती है, और इसे कैसे ठीक किया जाता है?

Key concepts

• मात्रात्मक लक्षण लोकी और मार्कर-लक्षण लिंकेज
• अंतराल मानचित्रण और एलओडी (LOD) स्कोर
• जीनोम-व्यापी जुड़ाव अध्ययन
• लिंकेज डिसइक्विलिब्रियम
• एक भ्रमित करने वाले कारक के रूप में जनसंख्या संरचना और इसका सुधार

Mechanisms

एक क्रॉस में, एक कारण लोकस के पास का एक मार्कर लक्षण के साथ सह-विभाजित होता है, इसलिए गुणसूत्र के साथ सांख्यिकीय संकेत में एक शिखर एक क्यूटीएल (QTL) को चिह्नित करता है; आबादी में, ऐतिहासिक पुनर्संयोजन कारण वेरिएंट को पास के मार्करों के साथ लिंकेज डिसइक्विलिब्रियम में छोड़ देता है, जिससे जुड़ाव स्कैन की अनुमति मिलती है, बशर्ते कि साझा वंशावली जो जीनोटाइप और लक्षण दोनों के साथ सहसंबंधित हो, उसे मॉडल से बाहर कर दिया जाए।

Clinical relevance

जुड़ाव मानचित्रण ने सामान्य मानव रोगों और लक्षणों से जुड़े हजारों वेरिएंट की पहचान की है, जो पॉलीजेनिक जोखिम स्कोर और दवा-लक्ष्य खोज को सूचित करते हैं, जबकि जनसंख्या संरचना को नियंत्रित करना, जैसा कि संरचना-अनुमान विधियों में औपचारिक रूप दिया गया है, गलत निष्कर्षों से बचने के लिए आवश्यक है।

History

प्रायोगिक क्रॉस में अंतराल क्यूटीएल (QTL) मानचित्रण को लगभग 1989 में औपचारिक रूप दिया गया था, फिर सघन मार्कर मानचित्रों ने बेहतर रिज़ॉल्यूशन को सक्षम किया, और 2000 के दशक के मध्य से जीनोम-व्यापी जुड़ाव अध्ययनों ने मानव आबादी तक मानचित्रण का विस्तार किया; जनसंख्या संरचना का अनुमान लगाने और उसे ठीक करने के तरीके, जैसे कि फालुश, स्टीफंस और प्रिचार्ड का मॉडल, ने इन अध्ययनों को विश्वसनीय बनाया।

Key figures

• Eric Lander
• Jonathan Pritchard
• Trudy Mackay

Seminal works

• falush2003
• lynchWalsh1998

Frequently asked questions

क्यूटीएल (QTL) मानचित्रण और जीनोम-व्यापी जुड़ाव अध्ययन में क्या अंतर है?

क्यूटीएल (QTL) मानचित्रण आमतौर पर नियंत्रित क्रॉस का उपयोग करता है जहां ज्ञात रिश्तेदार पुनर्संयोजन को सीधे ट्रैक करने की अनुमति देते हैं, जबकि एक जीनोम-व्यापी जुड़ाव अध्ययन एक आबादी में असंबंधित व्यक्तियों को स्कैन करता है, मार्करों और कारण वेरिएंट के बीच ऐतिहासिक लिंकेज डिसइक्विलिब्रियम पर निर्भर करता है।

जनसंख्या संरचना गलत जुड़ाव क्यों पैदा करती है?

यदि एक नमूने के उपसमूह वंशावली और लक्षण दोनों में भिन्न होते हैं, तो कोई भी एलील जो केवल एक उपसमूह में अधिक सामान्य होता है, लक्षण से जुड़ा हुआ दिखाई देगा; वंशावली के लिए सुधार इन गलत संकेतों को हटा देता है।