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Process / pipelineSoil and plant microbiome ecology

Analyse d'Amplicons de la Rhizosphère — Profilage du Microbiome de la Zone Racinaire

L'analyse d'amplicons de la rhizosphère est un pipeline moléculaire-écologique utilisé pour caractériser les communautés microbiennes qui habitent la zone de sol adjacente aux racines — la rhizosphère — en séquençant des gènes marqueurs ciblés tels que le gène ARNr 16S bactérien ou la région ITS fongique. Largement appliquée en agronomie, en écologie du sol et en pathologie végétale, elle permet aux chercheurs d'identifier quels microorganismes sont présents, comment leur composition évolue sous différentes cultures, traitements ou conditions de sol, et comment la structure de la communauté est liée à la santé et à la productivité des plantes.

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Sources

  1. Lundberg, D. S., Lebeis, S. L., Paredes, S. H., Yourstone, S., Gehring, J., Malfatti, S., ... & Dangl, J. L. (2012). Defining the core Arabidopsis thaliana root microbiome. Nature, 488(7409), 86-90. DOI: 10.1038/nature11237
  2. Berendsen, R. L., Pieterse, C. M., & Bakker, P. A. (2012). The rhizosphere microbiome and plant health. Trends in Plant Science, 17(8), 478-486. DOI: 10.1016/j.tplants.2012.04.001

Comment citer cette page

ScholarGate. (2026, June 3). Rhizosphere Amplicon Sequencing and Community Profiling. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/agronomy/rhizosphere-amplicon-analysis

ScholarGateRhizosphere Amplicon Analysis (Rhizosphere Amplicon Sequencing and Community Profiling). Consulté le 2026-06-15 sur https://scholargate.app/fr/agronomy/rhizosphere-amplicon-analysis · Jeu de données : https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026