جمعآوری نمونه و تأیید آزمایشگاهی
تأیید آزمایشگاهی با مشخص کردن عامل بیماریزا و اینکه کدام موارد واقعاً به آن مبتلا هستند، اساس بررسی یک شیوع را تشکیل میدهد. این فرآیند با جمعآوری نمونههای بالینی یا محیطی مناسب، در زمان مناسب، از افراد مناسب آغاز میشود و از طریق انتقال، آزمایش و تعیین نوع در آزمایشگاه ادامه مییابد و در نهایت موارد تأیید شده را از مواردی که صرفاً با توصیف بالینی مطابقت دارند، متمایز میکند.
Definition
جمعآوری نمونه و تأیید آزمایشگاهی عبارت است از به دست آوردن، انتقال و آزمایش نمونههای بالینی یا محیطی برای شناسایی و توصیف عامل ایجادکننده یک شیوع، که امکان تأیید تشخیص، طبقهبندی موارد و ارتباط آزمایشگاهی بین موارد را فراهم میکند.
Scope
این موضوع به چرایی و چگونگی جمعآوری نمونهها در طول یک بررسی، نقش آزمایشگاه در تأیید تشخیص و اصلاح تعریف مورد به سطوح تأیید شده، محتمل و مشکوک، و استفاده از تعیین نوع آزمایشگاهی و توالییابی ژنوم برای ارتباط دادن موارد میپردازد. این موضوع مفهومی و روششناختی است. پروتکلهای مربوط به نحوه نگهداری نمونه، آستانههای آزمایش یا روشهای ایمنی زیستی برای هیچ عامل بیماریزای خاصی را ارائه نمیدهد، که این موارد توسط دستورالعملهای آزمایشگاهی و بهداشت عمومی تعیین میشوند.
Core questions
- کدام نمونهها، از چه کسی و در چه مرحلهای از بیماری، عامل را به بهترین وجه شناسایی میکنند؟
- نمونهها چگونه جمعآوری، منتقل و آزمایش میشوند تا نتایج معتبر باشند؟
- تأیید آزمایشگاهی چگونه دستههای موارد تأیید شده، محتمل و مشکوک را تعریف میکند؟
- تعیین نوع آزمایشگاهی یا توالییابی ژنوم چگونه میتواند موارد را به یکدیگر و به یک منبع مرتبط کند؟
Key concepts
- نمونههای بالینی و محیطی
- زمان جمعآوری نسبت به بیماری
- انتقال نمونه و زنجیره نگهداری
- دستههای موارد تأیید شده، محتمل و مشکوک
- حساسیت و ویژگی آزمایش تشخیصی
- تعیین نوع و زیرگروهبندی آزمایشگاهی
- توالییابی کل ژنوم برای ارتباط موارد
Mechanisms
نمونههای مناسب، مانند نمونههای تنفسی، مدفوع، خون، یا غذا و آب آلوده، از تعداد کافی از موارد جمعآوری میشوند، در حالت ایدهآل قبل از اینکه درمان نتیجه را تغییر دهد، و تحت شرایطی که عامل را حفظ کند و با مستندسازی دقیق، منتقل میشوند. سپس آزمایشگاه عامل را شناسایی و تشخیص میدهد، و این نتایج تعریف مورد را به سطوحی دقیقتر تقسیم میکند: یک مورد تأیید شده معیارهای آزمایشگاهی را برآورده میکند، در حالی که موارد محتمل و مشکوک بر اساس ویژگیهای بالینی یا اپیدمیولوژیک هستند. زیرگروهبندی و توالییابی کل ژنوم بیشتر مشخص میکند که آیا موارد از یک سویه مشترک هستند یا خیر، که این امر ارتباط اپیدمیولوژیک آنها را تأیید یا رد میکند و به ارتباط موارد با یک منبع مشترک کمک میکند. ارزش تفسیری هر نتیجه به حساسیت و ویژگی آزمایش بستگی دارد.
Clinical relevance
پزشکان و کارکنان آزمایشگاه نمونهها را جمعآوری کرده و نتایجی را تولید میکنند که عامل شیوع را تأیید و موارد آن را طبقهبندی میکند، بنابراین کیفیت و زمانبندی جمعآوری مستقیماً بر بررسی تأثیر میگذارد. درک تأیید آزمایشگاهی به متخصصان بهداشت کمک میکند تا دلیل طبقهبندی یک مورد به عنوان تأیید شده به جای مشکوک را تفسیر کنند. این مدخل نقش تأیید آزمایشگاهی در بررسیها را توصیف میکند و پروتکل نگهداری نمونه، ایمنی زیستی یا تشخیص برای هیچ عامل بیماریزای خاصی نیست.
Epidemiology
تأیید آزمایشگاهی در شناسایی سارس به عنوان یک بیماری جدید و متمایز در سال ۲۰۰۳، که در آن توصیف بالینی و آزمایشگاهی سندرم و موارد آن را تعریف کرد، نقش محوری داشت. به طور گستردهتر، ادغام توالییابی ژنوم عامل بیماریزا با دادههای اپیدمیولوژیک به روشی استاندارد برای تأیید عوامل و ارتباط دادن موارد در بررسیهای شیوع تبدیل شده است، که هم طبقهبندی موارد و هم انتساب منبع را تقویت میکند.
History
باکتریشناسی در اواخر قرن نوزدهم برای اولین بار امکان ارتباط شیوعها را با ارگانیسمهای شناسایی شده خاص فراهم کرد، و اپیدمیولوژی میدانی قرن بیستم تأیید آزمایشگاهی را در تعاریف مورد طبقهبندی شده از موارد تأیید شده، محتمل و مشکوک گنجاند. زیرگروهبندی مولکولی و اخیراً توالییابی کل ژنوم، نقش آزمایشگاه را از نامگذاری عامل به حل و فصل اینکه کدام موارد مرتبط هستند، گسترش داد و شواهد آزمایشگاهی و اپیدمیولوژیک را یکپارچه کرد.
Debates
- تعاریف مورد چگونه باید تأیید آزمایشگاهی را در برابر حساسیت متعادل کنند؟
- الزام به تأیید آزمایشگاهی ویژگی را افزایش میدهد اما ممکن است موارد واقعی فاقد آزمایش مثبت را از دست بدهد، در حالی که تعاریف بالینی گسترده موارد بیشتری را به قیمت شامل شدن موارد غیربیمار پوشش میدهند؛ بنابراین، بررسیها از تعاریف طبقهبندی شده استفاده میکنند و آنها را با تکامل ظرفیت آزمایش و نیازهای بررسی تنظیم میکنند.
Key figures
- Michael Gregg
- Yonatan Grad
- Marc Lipsitch
Related topics
Seminal works
- lee-2003
- grad-lipsitch-2014
Frequently asked questions
- چرا موارد به عنوان تأیید شده، محتمل یا مشکوک طبقهبندی میشوند؟
- تعاریف مورد طبقهبندی شده به یک بررسی اجازه میدهد تا دقت و جامعیت را متعادل کند: موارد تأیید شده معیارهای آزمایشگاهی را برآورده میکنند و بیشترین ویژگی را دارند، در حالی که دستههای محتمل و مشکوک موارد سازگار بالینی یا اپیدمیولوژیک را که فاقد تأیید آزمایشگاهی هستند، پوشش میدهند تا موارد واقعی در مراحل اولیه از دست نروند.
- توالییابی ژنوم چگونه به تأیید یک شیوع کمک میکند؟
- فراتر از نامگذاری عامل، توالییابی ژنومهای ایزولهها را از موارد مختلف مقایسه میکند؛ توالیهای نزدیک به هم این نتیجهگیری را تأیید میکنند که موارد بخشی از یک شیوع هستند و ممکن است منبع مشترکی داشته باشند، که مکمل شواهد اپیدمیولوژیک است.