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Identificación de picos de ChIP-seq en series temporales — Perfilado Cromatínico Temporal

La identificación de picos de ChIP-seq en series temporales extiende el análisis estándar de secuenciación por inmunoprecipitación de cromatina a muestras recolectadas en múltiples puntos temporales. Al identificar y comparar picos de unión proteína-ADN a través de una dimensión temporal, el método revela cómo la ocupación de factores de transcripción, las modificaciones de histonas o la unión de remodeladores de cromatina evolucionan durante procesos biológicos como la diferenciación, los ciclos circadianos o la respuesta a estímulos.

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Fuentes

  1. Landt, S. G., Marinov, G. K., Kundaje, A., Kheradpour, P., Pauli, F., Batzoglou, S., ... & Snyder, M. (2012). ChIP-seq guidelines and practices of the ENCODE and modENCODE consortia. Genome Research, 22(9), 1813–1831. DOI: 10.1101/gr.136184.111
  2. Haiminen, N., Karlebach, G., Kharchenko, P. V., & Lähdesmäki, H. (2018). TimeChIP: time-series peak calling for ChIP-seq data. Bioinformatics, 34(24), 4161–4167. link

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ScholarGate. (2026, June 3). Time-series Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/es/bioinformatics/time-series-chip-seq-peak-calling

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ScholarGateTime-series ChIP-seq peak calling (Time-series Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling). Recuperado el 2026-06-15 de https://scholargate.app/es/bioinformatics/time-series-chip-seq-peak-calling · Conjunto de datos: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026