实验室诊断和培养技术
实验室诊断和培养技术是临床微生物学实验室检测、培养和鉴定导致感染的细菌的方法。本领域将引导读者了解完整的诊断路径，从样本的采集和运输，到微生物的培养、命名和通过表型或分子方法确认，以及确保结果可靠的质量体系。
Definition
实验室诊断和培养技术包括临床细菌学中用于从临床样本中分离、鉴定和表征细菌病原体的分析和前分析方法，涵盖培养、表型鉴定、分子检测和质量保证。
Scope
本领域将细菌学诊断的各个组成部分作为一个相互关联的工作流程进行调查：适当的样本选择和处理、用于恢复微生物的培养基和孵育条件、基于表型和质谱的鉴定、核酸扩增和其他分子诊断，以及实验室质量控制。它将这些作为理解实验室证据如何产生的参考概念，而不是作为针对个体患者订购或解释检测的手册。
Sub-topics
Core questions
- 实验室如何从临床样本中分离出细菌病原体？
- 什么决定了培养出的微生物是病原体、定植菌还是污染物？
- 一旦分离出细菌，如何对其进行鉴定？有哪些新的方法可以补充或替代培养？
- 哪些质量体系确保微生物学结果准确且可重复？
Key concepts
- 前分析、分析和后分析阶段
- 培养基和孵育条件
- 表型鉴定
- 基质辅助激光解吸电离飞行时间（MALDI-TOF）质谱法
- 核酸扩增检测
- 样本质量和污染
- 实验室质量控制和能力验证
Mechanisms
细菌学诊断遵循一个工作流程，其有效性取决于每个步骤。采集代表感染部位的样本，并在保持微生物活力的条件下运输，然后接种到培养基上，并在适合于可疑病原体的环境中孵育。检查生长情况，并通过表型反应或（越来越多地）通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法（MALDI-TOF）鉴定分离株；分子方法可以直接从样本中检测微生物，无需事先培养。在此过程中，质量控制程序验证培养基、试剂和仪器按预期运行，从而使报告结果反映患者情况而非实验室假象。权威指南将实验室和临床医生视为合作伙伴，他们共同决定采集和检测什么，从而决定诊断产出（Baron 2013）。
Clinical relevance
这些方法产生的结果是归因感染到特定微生物和追踪耐药性的许多证据的基础。了解诊断路径有助于读者评估为什么尽管存在感染，培养结果可能为阴性；为什么阳性培养结果可能代表污染；以及新的分子和蛋白质组学工具如何改变诊断周转时间。本领域描述了实验室证据是如何产生的，而不是个体诊断或治疗决策的依据。
Evidence & guidelines
美国传染病学会和美国微生物学会的共识指南描述了感染性疾病诊断中适当的样本选择和实验室利用（Baron 2013）。《临床微生物学手册》等参考文本对标准培养和鉴定方法进行了编码（Jorgensen 2015），并且有评论文章描绘了向更快分子和蛋白质组学诊断的转变（Caliendo 2013）。
History
诊断细菌学起源于19世纪末早期微生物学家的培养方法，并在20世纪发展成为标准化的表型方案。20世纪末和21世纪初带来了核酸扩增和MALDI-TOF质谱技术，这些技术缩短了鉴定时间，并在某些情况下允许无需培养即可检测（Caliendo 2013）。
Related topics
Seminal works
- baron-2013
- jorgensen-2015
- caliendo-2013
Frequently asked questions
- 临床微生物学实验室究竟做什么？
- 它利用培养、表型和分子鉴定以及质量体系，从临床样本中分离、鉴定和表征微生物，从而使结果可靠地反映患者体内存在的情况。
- 现在有了分子检测，还需要培养吗？
- 培养仍然至关重要，因为它能分离出活的菌株用于进一步检测，但分子和质谱方法通过加速鉴定，并在某些目标中直接从样本中检测微生物，越来越多地对其进行补充。