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时间序列系统发育分析 — 时间系统发育学
时间序列系统发育分析利用在已知时间点采集的序列来重建生物或遗传变异体的进化历史。通过将采样日期直接纳入模型,它可以估算绝对时间尺度上的分歧时间、取代率和祖先关系,这对于研究病毒爆发、古代DNA动力学和快速微生物进化至关重要。
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来源
- Drummond, A. J., & Rambaut, A. (2007). BEAST: Bayesian evolutionary analysis by sampling trees. BMC Evolutionary Biology, 7, 214. DOI: 10.1186/1471-2148-7-214 ↗
- Bouckaert, R., Vaughan, T. G., Barido-Sottani, J., Duchene, S., Fourment, M., Gavryushkina, A., et al. (2019). BEAST 2.5: An advanced software platform for Bayesian evolutionary analysis. PLOS Computational Biology, 15(4), e1006650. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1006650 ↗
如何引用本页
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Phylogenetic Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/zh/bioinformatics/time-series-phylogenetic-analysis
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