Chẩn đoán nấm và các phương pháp xét nghiệm
Chẩn đoán nấm là một chuyên ngành xét nghiệm nhằm phát hiện, nhận dạng và mô tả các loại nấm gây bệnh ở người. Nó bao gồm các phương pháp cổ điển như nuôi cấy và kính hiển vi, các xét nghiệm kháng nguyên và kháng thể miễn dịch, và các kỹ thuật phân tử bao gồm PCR và giải trình tự DNA, kết hợp chúng lại để xác nhận hoặc loại trừ nhiễm nấm và xác định sinh vật gây bệnh.
Definition
Chẩn đoán nấm và các phương pháp xét nghiệm là các kỹ thuật và quy trình được sử dụng trong phòng thí nghiệm lâm sàng để thu hồi, hình dung, nhận dạng và mô tả các loại nấm quan trọng về mặt y tế từ các mẫu bệnh phẩm, bao gồm các phương pháp tiếp cận kiểu hình, miễn dịch và phân tử.
Scope
Lĩnh vực này định hướng cho người đọc về các nhóm phương pháp xét nghiệm chính được sử dụng trong nấm học y tế: nuôi cấy và phân lập nấm, kiểm tra và nhuộm chúng dưới kính hiển vi, khuếch đại và giải trình tự axit nucleic của chúng, phát hiện kháng nguyên và kháng thể của vật chủ, và đo lường các dấu ấn sinh học và các đặc điểm liên quan đến màng sinh học. Nó coi đây là phương pháp chẩn đoán hơn là hướng dẫn điều trị, và chỉ ra các nút chủ đề chuyên biệt để biết chi tiết.
Sub-topics
Core questions
- Có nấm trong mẫu vật này không, và nó là chất gây ô nhiễm hay mầm bệnh thực sự?
- Chi hoặc loài nào chịu trách nhiệm, và có thể đặt tên nó một cách tự tin đến mức nào?
- Sự kết hợp nào giữa nuôi cấy, kính hiển vi, kháng nguyên và các phương pháp phân tử phù hợp nhất với câu hỏi lâm sàng và loại mẫu vật?
- Các phát hiện xét nghiệm dương tính và âm tính được giải thích như thế nào trong các định nghĩa tiêu chuẩn về bệnh nấm xâm lấn?
Key concepts
- Nhận dạng kiểu hình so với phân tử
- Phát hiện trực tiếp so với thu hồi dựa trên nuôi cấy
- Độ nhạy và độ đặc hiệu của các xét nghiệm nấm
- Bệnh nấm xâm lấn đã được chứng minh, có thể và có thể xảy ra
- Chất lượng mẫu vật và kiểm soát ô nhiễm
- Nhận dạng đa pha
Mechanisms
Nấm học xét nghiệm kết hợp các tín hiệu bổ sung. Nuôi cấy thu hồi các sinh vật sống và cho phép nhận dạng hình thái và thử nghiệm tính nhạy cảm nhưng thường chậm và không nhạy đối với bệnh xâm lấn. Kính hiển vi và mô bệnh học trực tiếp hình dung các yếu tố nấm trong mẫu vật, cung cấp bằng chứng nhanh chóng về sự xâm lấn mô. Các xét nghiệm kháng nguyên và huyết thanh học phát hiện các thành phần thành tế bào nấm hoặc phản ứng kháng thể của vật chủ mà không cần nuôi cấy. Các phương pháp phân tử khuếch đại và giải trình tự DNA bảo tồn hoặc đặc hiệu loài, và phổ khối lượng phân tích protein, cho phép nhận dạng nhanh chóng và chính xác. Chẩn đoán hiện đại là đa pha, tích hợp một số phương pháp này, và các định nghĩa đồng thuận được tiêu chuẩn hóa quy định cách các kết quả kết hợp thành các loại bệnh nấm xâm lấn.
Clinical relevance
Các phương pháp được nhóm ở đây tạo ra bằng chứng để nhận biết và đặt tên các bệnh nhiễm nấm trong thực hành lâm sàng và nghiên cứu. Hiểu được điểm mạnh và hạn chế của chúng giúp đánh giá các báo cáo chẩn đoán và bằng chứng nghiên cứu. Mục này là tài liệu tham khảo mô tả về cách các chẩn đoán nấm được thiết lập và không phải là một quy trình để xét nghiệm, kê đơn hoặc quản lý bệnh nhân cá nhân.
Evidence & guidelines
Các định nghĩa đồng thuận từ EORTC và Mycoses Study Group Education and Research Consortium tiêu chuẩn hóa cách kết hợp các phát hiện nấm học và lâm sàng thành các loại bệnh nấm xâm lấn, cung cấp một khuôn khổ chung cho chẩn đoán và nghiên cứu. Các văn bản tham khảo như Atlas of Clinical Fungi liệt kê các đặc điểm hình thái được sử dụng trong nhận dạng kiểu hình, trong khi các đánh giá về mô bệnh học và phổ khối lượng ghi lại vai trò của các phương pháp nhận dạng mới hơn.
History
Chẩn đoán nấm phát triển từ nuôi cấy và kính hiển vi thế kỷ XIX và XX, trong đó nấm được thu hồi trên môi trường chọn lọc và nhận dạng bằng hình thái khuẩn lạc và kính hiển vi. Cuối thế kỷ XX đã bổ sung các xét nghiệm miễn dịch đối với kháng nguyên nấm và kháng thể của vật chủ, và sự ra đời của PCR, giải trình tự DNA của các vùng ribosome, và phổ khối lượng MALDI-TOF đã biến đổi việc nhận dạng theo hướng chính xác phân tử và proteomic, trong khi các định nghĩa đồng thuận tiêu chuẩn hóa việc giải thích.
Related topics
Seminal works
- donnelly-2020
- guarner-2011
- dehoog-2020
Frequently asked questions
- Tại sao lại sử dụng nhiều phương pháp khác nhau để chẩn đoán nhiễm nấm?
- Không có phương pháp nào vừa nhanh vừa đáng tin cậy cho mọi tình huống. Nuôi cấy, kính hiển vi, xét nghiệm kháng nguyên và xét nghiệm phân tử mỗi loại phát hiện một khía cạnh khác nhau của nấm, vì vậy việc kết hợp chúng sẽ cải thiện cơ hội chẩn đoán chính xác và kịp thời.
- Sự khác biệt giữa phát hiện nấm và nhận dạng nó là gì?
- Phát hiện xác định rằng có nấm, ví dụ bằng cách nhìn thấy các yếu tố nấm hoặc phát hiện kháng nguyên. Nhận dạng đặt tên chi hoặc loài, điều này thường yêu cầu hình thái nuôi cấy, giải trình tự hoặc phổ khối lượng.