Phân tích làm giàu tập hợp gen (GSEA)
Phân tích làm giàu tập hợp gen (GSEA) là một phương pháp tính toán xác định xem một tập hợp gen được xác định trước — đại diện cho một con đường sinh học, quá trình hoặc chức năng — có cho thấy sự khác biệt có ý nghĩa thống kê, phối hợp giữa hai điều kiện sinh học hay không. Không giống như lọc theo tỷ lệ thay đổi đơn giản, GSEA hoạt động trên tất cả các gen được đo lường, được xếp hạng theo một chỉ số tương quan, phát hiện các dịch chuyển tinh tế nhưng nhất quán trên toàn bộ con đường ngay cả khi không có gen đơn lẻ nào vượt qua ngưỡng ý nghĩa.
Đọc toàn bộ phương pháp
Đăng nhập bằng tài khoản miễn phí để đọc phần này.
Bản đồ phương pháp
Lân cận của các phương pháp liên quan — chọn một nút để khám phá.
+27 nữa
Nguồn tài liệu
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Mootha, V. K., Lindgren, C. M., Eriksson, K. F., Subramanian, A., Sihag, S., Lehar, J., Puigserver, P., Carlsson, E., Ridderstrale, M., Laurila, E., Houstis, N., Daly, M. J., Patterson, N., Mesirov, J. P., Golub, T. R., Tamayo, P., Spiegelman, B., Lander, E. S., Hirschhorn, J. N., Altshuler, D., & Groop, L. C. (2003). PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes. Nature Genetics, 34(3), 267–273. DOI: 10.1038/ng1180 ↗
Cách trích dẫn trang này
ScholarGate. (2026, June 3). Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/vi/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis
Phương pháp nào?
Đặt phương pháp này bên cạnh những phương pháp gần gũi nhất với nó và đọc chúng song song — thư viện bày sách lên bàn; lựa chọn là của bạn.
- Phân tích làm giàu tập hợp gen đa omicsTin sinh học↔ so sánh
- Phân tích làm giàu tập hợp gen dựa trên mạng lướiTin sinh học↔ so sánh
- Phân tích làm giàu đường dẫnTin sinh học↔ so sánh
- Phân tích biểu hiện gen khác biệt RNA-seqTin sinh học↔ so sánh
- Phân tích RNA-seq đơn bàoTin sinh học↔ so sánh
Được tham chiếu bởi
Similar methods
Phát hiện lỗi trên trang này? Báo cáo hoặc đề xuất chỉnh sửa →