Phân tích RNA-seq đơn bào dựa trên mạng lưới
Phân tích RNA-seq đơn bào dựa trên mạng lưới mở rộng các quy trình scRNA-seq tiêu chuẩn bằng cách xây dựng và truy vấn các mạng lưới tương tác phân tử — mạng lưới điều hòa gen, mạng lưới đồng biểu hiện, hoặc đồ thị giao tiếp giữa các tế bào — từ dữ liệu phiên mã đơn bào. Thay vì coi mỗi gen một cách độc lập, phương pháp này nắm bắt hoạt động phối hợp của các mạch gen và các con đường tín hiệu liên bào trong và giữa các quần thể tế bào, cho phép có cái nhìn ở cấp độ hệ thống về điều hòa phiên mã ở độ phân giải đơn bào.
Đọc toàn bộ phương pháp
Đăng nhập bằng tài khoản miễn phí để đọc phần này.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Nguồn tài liệu
- Aibar, S., González-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., ... & Aerts, S. (2017). SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083–1086. link ↗
- Jin, S., Guerrero-Juarez, C. F., Zhang, L., Chang, I., Ramos, R., Kuan, C. H., ... & Nie, Q. (2021). Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat. Nature Communications, 12(1), 1088. link ↗
Cách trích dẫn trang này
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/vi/bioinformatics/network-based-single-cell-rna-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Phân tích làm giàu tập hợp gen (GSEA)Tin sinh học↔ compare
- Phân tích biểu hiện vi sai RNA-seq dựa trên mạngTin sinh học↔ compare
- Phân tích làm giàu đường dẫnTin sinh học↔ compare
- Phân tích biểu hiện gen khác biệt RNA-seqTin sinh học↔ compare
- Phân tích eQTL đơn bàoTin sinh học↔ compare
- Phân tích RNA-seq đơn bàoTin sinh học↔ compare
Phát hiện lỗi trên trang này? Báo cáo hoặc đề xuất chỉnh sửa →