Phân tích đa dạng hệ vi sinh vật bằng phương pháp Bayes — Đánh giá xác suất cấu trúc cộng đồng

Phân tích đa dạng hệ vi sinh vật bằng phương pháp Bayes áp dụng các mô hình xác suất — chủ yếu là Dirichlet-Multinomial và các khung phân cấp liên quan — cho dữ liệu đếm từ 16S rRNA hoặc metagenomic shotgun để ước tính đa dạng alpha (độ phong phú và độ đồng đều trong mẫu) và đa dạng beta (sự khác biệt về thành phần giữa các mẫu) đồng thời lan truyền sự không chắc chắn qua toàn bộ chuỗi suy luận. Không giống như các phương pháp dựa trên lấy mẫu lại (rarefaction) theo tần suất, các phương pháp Bayes coi số lượng taxon là các mẫu rút ra từ một thành phần tiềm ẩn, cho phép khoảng tin cậy trên các chỉ số đa dạng và so sánh có nguyên tắc giữa các nhóm có độ sâu giải trình tự không bằng nhau.