Phân tích làm giàu đường dẫn dựa trên mạng lưới
Phân tích làm giàu đường dẫn dựa trên mạng lưới tích hợp các mạng lưới tương tác phân tử — tương tác protein-protein, đồ thị tín hiệu, hoặc mạng lưới điều hòa gen — với các phép đo omics để xác định các đường dẫn sinh học bị thay đổi đồng bộ trong một điều kiện nhất định. Khác với các phương pháp cổ điển dựa trên sự quá mức hoặc làm giàu tập hợp gen, vốn coi các gen trong đường dẫn là các danh sách độc lập, họ phương pháp này lan truyền tín hiệu qua các cạnh mạng lưới, nắm bắt cấu trúc tô pô của các tương tác và khám phá các mô-đun bị rối loạn mà phương pháp làm giàu danh sách phẳng sẽ bỏ sót.
Đọc toàn bộ phương pháp
Đăng nhập bằng tài khoản miễn phí để đọc phần này.
Bản đồ phương pháp
Lân cận của các phương pháp liên quan — chọn một nút để khám phá.
Nguồn tài liệu
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link ↗
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182 ↗
Cách trích dẫn trang này
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/vi/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis
Phương pháp nào?
Đặt phương pháp này bên cạnh những phương pháp gần gũi nhất với nó và đọc chúng song song — thư viện bày sách lên bàn; lựa chọn là của bạn.
- Phân tích làm giàu tập hợp gen (GSEA)Tin sinh học↔ so sánh
Được tham chiếu bởi
Phát hiện lỗi trên trang này? Báo cáo hoặc đề xuất chỉnh sửa →