Phân tích làm giàu tập hợp gen đơn bào — scGSEA
Phân tích làm giàu tập hợp gen đơn bào (scGSEA) mở rộng GSEA cổ điển sang độ phân giải của từng tế bào. Thay vì kiểm tra xem một tập hợp gen có được làm giàu trong so sánh cấp mẫu hay không, scGSEA gán điểm làm giàu hoặc hoạt động cho mỗi tế bào, cho phép các nhà nghiên cứu lập bản đồ hoạt động của con đường trao đổi chất trên các quần thể tế bào không đồng nhất, các trạng thái tế bào và các quỹ đạo phát triển được ghi lại trong dữ liệu RNA-seq đơn bào.
Đọc toàn bộ phương pháp
Đăng nhập bằng tài khoản miễn phí để đọc phần này.
Bản đồ phương pháp
Lân cận của các phương pháp liên quan — chọn một nút để khám phá.
Nguồn tài liệu
- Aibar, S., Gonzalez-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., Rambow, F., Marine, J.-C., Geurts, P., Aerts, J., van den Oord, J., Kalender Atak, Z., Wouters, J., & Aerts, S. (2017). SCENIC: Single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083-1086. link ↗
- DeTomaso, D., Jones, M. G., Subramaniam, M., Ashuach, T., Ye, C. J., & Yosef, N. (2019). Functional interpretation of single cell similarity maps. Nature Communications, 10(1), 4376. link ↗
Cách trích dẫn trang này
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/vi/bioinformatics/single-cell-gene-set-enrichment-analysis
Phương pháp nào?
Đặt phương pháp này bên cạnh những phương pháp gần gũi nhất với nó và đọc chúng song song — thư viện bày sách lên bàn; lựa chọn là của bạn.
- Phân tích làm giàu tập hợp gen (GSEA)Tin sinh học↔ so sánh
- Phân tích làm giàu đường dẫnTin sinh học↔ so sánh
- Phân tích biểu hiện gen khác biệt RNA-seqTin sinh học↔ so sánh
- Phân tích RNA-seq đơn bàoTin sinh học↔ so sánh
- Single-cell RNA-seq differential expressionTin sinh học↔ so sánh
Được tham chiếu bởi
Similar methods
Phát hiện lỗi trên trang này? Báo cáo hoặc đề xuất chỉnh sửa →