Farmakogenomik Testler ve Klinik Uygulama
Farmakogenomik testler ve klinik uygulama, farmakogenomiğin uygulamalı yönünü oluşturmaktadır: ilaç metabolizması ve ilaç hedef genlerindeki kalıtsal varyasyonun bir hasta örneğinde nasıl ölçüldüğü, öngörülen bir ilaç yanıtı fenotipine nasıl dönüştürüldüğü ve klinisyenlere kullanılabilir bir biçimde nasıl sunulduğu incelenmektedir. Bu alan, varyantları tespit eden laboratuvar teknolojilerini, hangi gen-ilaç çiftlerinin eyleme geçirilebilir olduğuna karar veren kanıt çerçevelerini, test zamanlamasına ilişkin modelleri, sonuç raporlama standartlarını ve reçeteleme anında rehberlik sağlayan elektronik sistemleri kapsamaktadır.
Tanım
Farmakogenomik testler ve klinik uygulama, ilaç yanıtını etkileyen genetik varyasyonun tespit edildiği, bir fenotipe sınıflandırıldığı, raporlandığı ve reçeteleme kararlarını bilgilendirmek üzere klinik iş akışlarına entegre edildiği laboratuvar, yorumlama ve bilişim süreçleri bütünüdür.
Kapsam
Bu alan, okuyucuyu genetik testten klinik eyleme uzanan uçtan uca sürece yönlendirmektedir. Farmakogenomik laboratuvarlarda kullanılan genotipleme ve dizileme teknolojilerini, kılavuz ve kanıt düzeyi çerçevelerini (özellikle Klinik Farmakogenetik Uygulama Konsorsiyumu'nun (CPIC) çerçevelerini), önleyici ve reaktif test arasındaki stratejik seçimi, sonuçların yorumlanmasını ve standartlaştırılmış raporlamasını, ayrıca farmakogenomik uyarıları elektronik sağlık kaydına entegre eden klinik karar destek sistemlerini tanıtmaktadır. Bu konular, klinik talimatlar olarak değil, uygulama bilimi ve laboratuvar tıbbında referans konular olarak ele alınmaktadır.
Alt konular
Temel sorular
- Farmakogenlerdeki genetik varyasyon nasıl tespit edilmektedir ve farklı teknolojiler neleri yakalamakta veya neleri gözden kaçırmaktadır?
- Hangi gen-ilaç çiftleri klinik olarak eyleme geçirilebilir olmak için yeterli kanıta sahiptir ve buna kim karar vermektedir?
- Genotipleme, bir popülasyonda önleyici olarak mı yoksa bir ilaç düşünüldüğünde reaktif olarak mı yapılmalıdır?
- Ham genotipler standartlaştırılmış fenotiplere nasıl dönüştürülmekte ve klinik bir raporda nasıl iletilmektedir?
- Farmakogenomik rehberlik, uyarı yorgunluğuna neden olmadan reçete yazanlara güvenilir bir şekilde nasıl ulaştırılabilir?
Anahtar kavramlar
- Gen-ilaç çifti eyleme geçirilebilirliği
- Genotipten fenotipe çeviri
- Yıldız (*) allel nomenklatürü
- Önleyiciye karşı reaktif test
- Klinik karar desteği ve elektronik sağlık kaydı
- Kanıt düzeyleri ve kılavuz gücü
- Standartlaştırılmış sonuç terminolojisi
Mekanizmalar
Uygulama bir süreç hattını takip etmektedir. Bir laboratuvar, hedeflenmiş genotipleme dizileri veya dizileme kullanarak farmakogenlerdeki varyantları tespit etmektedir; tespit edilen aleller yıldız-allel nomenklatürü kullanılarak adlandırılmakta ve bir diplotipe birleştirilmektedir. Diplotip, konsensüs kuralları kullanılarak öngörülen bir metabolize edici veya yanıt fenotipine dönüştürülmektedir. Klinik Farmakogenetik Uygulama Konsorsiyumu gibi kanıt çerçeveleri, hangi gen-ilaç çiftlerinin eyleme geçirilebilir olmak için yeterli kanıta sahip olduğunu değerlendirmekte ve belirli bir fenotipin ilaç yanıtıyla nasıl ilişkili olduğuna dair rehberlik yayınlamaktadır. Sonuç, standartlaştırılmış terimlerle raporlanmakta ve giderek artan bir şekilde elektronik sağlık kaydında saklanmaktadır, böylece klinik karar desteği, ilgili bir ilaç reçete edildiğinde uygun rehberliği sunabilmektedir (Roden, 2019; Relling & Klein, 2011; Relling vd., 2019).
Klinik önem
Farmakogenomik uygulama, ilaç yanıtına ilişkin genetik bilginin klinik bakıma ulaşmasını sağlayan altyapıyı tanımlamaktadır; bu altyapıyı anlamak, klinisyenlere, laboratuvar uzmanlarına ve bilişimcilere bir farmakogenomik raporun neleri destekleyip neleri destekleyemeyeceğini değerlendirmede yardımcı olmaktadır. Buradaki konular, kanıt ve sonuçların nasıl üretildiğini, standartlaştırıldığını ve sunulduğunu karakterize etmekte olup, bireyselleştirilmiş reçeteleme veya dozaj kararları için bir kaynak olmaktan ziyade bir referans yönlendirme olarak amaçlanmaktadır.
Kanıt ve kılavuzlar
Bu alandaki baskın kanıt çerçevesi, gen-ilaç kanıtının gücünü derecelendiren ve belirlenmiş bir genotipe göre nasıl hareket edileceğini açıklayan hakemli kılavuzlar yayınlayan Klinik Farmakogenetik Uygulama Konsorsiyumu'dur (CPIC); Hollanda Farmakogenetik Çalışma Grubu ise paralel bir Avrupa çerçevesi sunmaktadır (Relling & Klein, 2011; Relling vd., 2019). Vanderbilt PREDICT projesi gibi büyük prospektif programlar, genotipleme ve karar desteğini rutin bakıma entegre etmeye yönelik operasyonel modelleri göstermiştir (Pulley vd., 2012). Bu çerçeveler kanıt ve süreci tanımlamaktadır; klinik yargının yerini tutmamaktadırlar.
Tarihçe
Farmakogenomik uygulama, onlarca yıllık farmakogenetik araştırmalarından 2010'larda organize bir klinik disipline dönüşmüştür. 2009 yılında Klinik Farmakogenetik Uygulama Konsorsiyumu'nun kurulması, gen-ilaç ilişkilerini eyleme geçirilebilir kılavuzlara dönüştürmek için ortak bir çerçeve sağlamıştır (Relling & Klein, 2011) ve Vanderbilt'in PREDICT projesi gibi erken kurumsal programlar, prospektif genotipleme ve elektronik karar desteğinin nasıl operasyonel hale getirilebileceğini göstermiştir (Pulley vd., 2012). On yıl sonra, bu alan standartlaştırılmış terminoloji ve artan elektronik sağlık kaydı entegrasyonu ile tanınabilir bir uygulama bilimine dönüşmüştür (Relling vd., 2019; Roden, 2019).
Tartışmalar
- Önleyiciye karşı reaktif test
- Hastaların herhangi bir ilaç reçete edilmeden önce sonuçların hazır olması için önceden genotiplenmesi mi, yoksa yalnızca belirli bir ilaç düşünüldüğünde reaktif olarak test edilmesi mi gerektiği, maliyet, veri hazırlığı ve klinik fayda açısından hala aktif olarak tartışılan dengeleri içermektedir.
Öne çıkan isimler
- Mary V. Relling
- Teri E. Klein
- Dan M. Roden
- Kelly E. Caudle
- Josh F. Peterson
İlgili konular
Temel eserler
- relling-2011
- pulley-2012
- relling-2019
- roden-2019
Sıkça sorulan sorular
- Farmakogenetik ve farmakogenomik test arasındaki fark nedir?
- Farmakogenetik tarihsel olarak tek gen-ilaç ilişkilerini ifade ederken, farmakogenomik ilaç yanıtı üzerindeki genom çapındaki etkileri kapsamaktadır; klinik uygulamada bu terimler, genetik varyasyondan ilaç yanıtını öngören testler için artık büyük ölçüde birbirinin yerine kullanılmaktadır.
- Bir farmakogenomik test, bir klinisyene tam olarak ne reçete edeceğini söyler mi?
- Hayır. Bir test öngörülen bir fenotipi rapor etmektedir; bunu bir reçeteleme kararına dönüştürmek, hastanın bütününü dikkate alan kanıta dayalı kılavuzlara ve klinik yargıya dayanmaktadır ve test sonucu tek başına bir tedavi talimatı değildir.