Poligenik Risk Skoru
Polygenic Risk Score for Disease Prediction and Stratification · Ayrıca şöyle bilinir: PRS, Polygenic score, Genomic risk score
Poligenik risk skoru (PRS), bir bireyin hastalığa veya diğer karmaşık özelliklere genetik yatkınlığını tahmin etmek için genom boyunca birçok genetik varyantın etkilerini birleştiren özet bir ölçümdür. İlk olarak 2007'de Purcell ve meslektaşları tarafından geliştirilen PRS yöntemleri, kişiselleştirilmiş bir risk tahmini oluşturmak için genom çapında ilişkilendirme çalışması (GWAS) sonuçlarını bireyin genotipiyle birleştirir. PRS yaklaşımları, yüksek genetik riske sahip popülasyonlarda risk sınıflandırması ve erken müdahale sağlayarak hassas tıpta devrim yaratmıştır.
Tam yöntemi oku
Bu bölümü okumak için ücretsiz hesapla giriş yapın.
Yöntem haritası
İlişkili yöntemlerin komşuluğu — keşfetmek için bir düğüm seçin.
Ne zaman kullanılır
PRS, bir özellik için GWAS özet istatistikleriniz ve hedef popülasyondaki bireyler üzerinde genotipleriniz olduğunda uygulanabilir. Klinik veya araştırma ortamlarında erken hastalık tespiti ve hasta sınıflandırması için en değerlidir. Önleyici müdahale için yüksek genetik riske sahip bireyleri belirlemek için PRS'yi kullanın. Dikkat: PRS performansı, GWAS örneklem boyutuna, GWAS ve hedef popülasyonlar arasındaki soy eşleşmesine ve özelliğin poligenikliğine bağlıdır. Avrupa popülasyonlarında geliştirilen PRS'yi doğrulama yapmadan Avrupa dışı bireylere uygulamaktan kaçının.
Güçlü yönler & sınırlılıklar
- Genotip ve GWAS özet verilerinden hesaplanması basittir
- Genel popülasyondan yüksek riskli bireyleri ayırt ederek önemli ölçüde risk sınıflandırması sağlayabilir
- Çeşitli özellikler ve hastalıklar üzerinde çalışır
- Geliştirilmiş tahmin için çevresel ve klinik risk faktörleriyle birleştirilebilir
- Ölçekte kişiselleştirilmiş tıp yaklaşımlarını mümkün kılar
- Tahmin doğruluğu genellikle mütevazıdır, özellikle çoğu GWAS'ın yürütüldüğü Avrupa dışı popülasyonlarda
- Soylar arası aktarılabilirlik sınırlıdır; bir soyda eğitilen PRS diğerlerinde kötü performans gösterir
- Karmaşıklık ekleyen bağlantı dengesizliği budama veya diğer LD ayarlamalarını gerektirir
- Gen-çevre veya gen-gen etkileşimlerini yakalamaz
- GWAS özet istatistiklerinin veya bireysel PRS değerlerinin paylaşılmasında gizlilik endişeleri
SSS
Poligenik risk skoru nasıl hesaplanır?
PRS şu şekilde hesaplanır: PRS = Σ(etki_boyutu_i × genotip_i), burada etki_boyutu GWAS'tan ve genotip, her varyant için risk allellerinin sayısıdır (0, 1 veya 2). Elde edilen skor daha sonra hedef popülasyonda ortalama 0 ve standart sapma 1 olacak şekilde standartlaştırılır.
PRS performansı popülasyonlar arasında neden farklılık gösterir?
Çoğu GWAS Avrupa soyundan gelen bireylerde yürütülür, bu nedenle PRS bu soy için optimize edilmiştir. Diğer soy gruplarına uygulandığında, bağlantı dengesizliği örüntüleri farklılık gösterir, etki boyutları değişebilir ve allel frekansları farklılık gösterir, bunların hepsi tahmin doğruluğunu azaltır. Soy çeşitliliğine sahip GWAS geliştirmek, eşit PRS için çok önemlidir.
Bağlantı dengesizliği (LD) budaması nedir ve neden yapılır?
Yakındaki varyantlar genellikle allel frekansında ilişkilidir. LD budaması, her yüksek oranda ilişkili çiftin bir varyantını kaldırarak çoklu doğrusallığı azaltır ve PRS stabilitesini artırır. Özellikle regresyon tabanlı PRS yapımında önemlidir.
PRS, hastalık tahmininde çevresel risk faktörlerinin yerini alabilir mi?
Hayır. Genetik ve çevresel faktörler genellikle karşılaştırılabilir tahmin gücüne sahiptir ve etkileşebilirler. En iyi uygulama, optimal risk tahmini ve hasta danışmanlığı için PRS'yi çevresel ve klinik risk faktörleriyle (sigara, diyet, kan basıncı) entegre eder.
Kaynaklar
- Purcell, S. M., Wray, N. R., Stone, J. L., Visscher, P. M., O'Donovan, M. C., Sullivan, P. F., & Sklar, P. (2007). Common polygenic variation contributes to risk of schizophrenia. Nature, 460(7256), 748–752. link ↗
- Evans, D. M., Visscher, P. M., & Wray, N. R. (2009). Harnessing the power of large B and T cell lymphoma genome-wide association studies. Nature Reviews Genetics, 10(7), 431–442. link ↗
- Khera, A. V., Chaffin, M., Wade, K. H., Zaharieva, S., King, C., Arvanitis, M., & Aherwar, D. (2018). Polygenic prediction of weight and obesity trajectories. PLoS Genetics, 15(7), e1007616. link ↗
Bu sayfayı kaynak gösterin
ScholarGate. (2026, June 3). Polygenic Risk Score for Disease Prediction and Stratification. ScholarGate. https://scholargate.app/tr/genetics/polygenic-risk-score
Hangi yöntem?
Bu yöntemi en yakın akrabalarının yanına koyup yan yana okuyun — kütüphane kitapları masaya serer; seçim sizindir.
- F-istatistikleri (FST)Genetik↔ karşılaştır
- LD Blok AnaliziGenetik↔ karşılaştır
- Kantitatif özellik lokusu (QTL) haritalaması, nicel özelliklereGenetik↔ karşılaştır
- İletim Dengesizlik Testi (TDT)Genetik↔ karşılaştır