Mikolojik Tanı ve Laboratuvar Yöntemleri
Mikolojik tanı, insan hastalıklarına neden olan mantarları tespit eden, tanımlayan ve karakterize eden bir laboratuvar disiplinidir. Kültür ve mikroskopi gibi klasik yöntemleri, immünolojik antijen ve antikor testlerini ve PCR ile DNA dizileme dahil moleküler teknikleri kapsamakta olup, mantar enfeksiyonunu doğrulamak veya dışlamak ve sorumlu organizmayı adlandırmak için bunları bir araya getirmektedir.
Tanım
Mikolojik tanı ve laboratuvar yöntemleri, fenotipik, immünolojik ve moleküler yaklaşımlar dahil olmak üzere, tıbbi açıdan önemli mantarları hasta örneklerinden geri kazanmak, görselleştirmek, tanımlamak ve başka şekillerde karakterize etmek için klinik laboratuvarda kullanılan teknikler ve prosedürlerdir.
Kapsam
Bu alan, okuyucuyu tıbbi mikolojide kullanılan başlıca laboratuvar yöntem ailelerine yönlendirmektedir: mantarları kültürde üretme ve izole etme, mikroskop altında inceleme ve boyama, nükleik asitlerini çoğaltma ve dizileme, antijenlerini ve konak antikorlarını tespit etme, biyobelirteçleri ve biyofilmle ilişkili özellikleri ölçme. Bu yöntemleri tedavi rehberliği yerine tanısal metodoloji olarak çerçevelemekte ve detaylar için ilgili konu düğümlerine işaret etmektedir.
Alt konular
Temel sorular
- Bu örnekte bir mantar var mı ve bu bir kontaminant mı yoksa gerçek bir patojen mi?
- Hangi cins veya tür sorumludur ve ne kadar güvenle adlandırılabilir?
- Kültür, mikroskopi, antijen ve moleküler yöntemlerin hangi kombinasyonu klinik soruya ve örnek tipine en uygunudur?
- Pozitif ve negatif laboratuvar bulguları, invaziv mantar hastalığının standartlaştırılmış tanımları içinde nasıl yorumlanır?
Anahtar kavramlar
- Fenotipik ve moleküler tanımlama
- Doğrudan tespit ve kültür tabanlı geri kazanım
- Mantar testlerinin duyarlılığı ve özgüllüğü
- Kanıtlanmış, olası ve mümkün invaziv mantar hastalığı
- Örnek kalitesi ve kontaminasyon kontrolü
- Polifazik tanımlama
Mekanizmalar
Laboratuvar mikolojisi, tamamlayıcı sinyalleri birleştirmektedir. Kültür, canlı organizmaları geri kazanır ve morfolojik tanımlama ile duyarlılık testine olanak tanır, ancak invaziv hastalıklar için genellikle yavaş ve duyarsızdır. Mikroskopi ve histopatoloji, mantar elemanlarını doğrudan örneklerde görselleştirerek doku invazyonunun hızlı kanıtını sunar. Antijen testleri ve seroloji, büyüme gerektirmeden mantar hücre duvarı bileşenlerini veya konak antikor yanıtlarını tespit eder. Moleküler yöntemler, korunmuş veya türe özgü DNA'yı çoğaltır ve diziler; kütle spektrometrisi ise proteinleri profiller, böylece hızlı ve hassas tanımlama sağlanır. Modern tanı polifaziktir, bu yöntemlerden birkaçını entegre etmektedir ve standartlaştırılmış konsensüs tanımları, sonuçların invaziv mantar hastalığı kategorilerine nasıl birleştiğini belirtmektedir.
Klinik önem
Burada gruplandırılan yöntemler, mantar enfeksiyonlarının klinik pratikte ve araştırmada tanınması ve adlandırılması için kanıt üretmektedir. Bu yöntemlerin güçlü yönlerini ve sınırlamalarını anlamak, tanı raporlarını ve çalışma kanıtlarını değerlendirmede yardımcı olmaktadır. Bu giriş, mantar tanılarının nasıl konulduğuna dair tanımlayıcı bir referans materyalidir ve bireysel hastaları test etme, reçete yazma veya yönetme protokolü değildir.
Kanıt ve kılavuzlar
EORTC ve Mikoz Çalışma Grubu Eğitim ve Araştırma Konsorsiyumu'ndan alınan konsensüs tanımları, mikolojik ve klinik bulguların invaziv mantar hastalığı kategorilerine nasıl birleştirildiğini standartlaştırmakta, tanı ve araştırma için ortak bir çerçeve sağlamaktadır. Klinik Mantarlar Atlası gibi referans metinler, fenotipik tanımlamada kullanılan morfolojik özellikleri kataloglarken, histopatoloji ve kütle spektrometrisi incelemeleri, daha yeni tanımlama yöntemlerinin rolünü belgelemektedir.
Tarihçe
Tanısal mikoloji, on dokuzuncu ve yirminci yüzyıl kültür ve mikroskopisinden gelişmiştir; bu dönemde mantarlar seçici besiyerlerinde geri kazanılmış ve koloni ile mikroskobik morfoloji ile tanımlanmıştır. Yirminci yüzyılın sonları, mantar antijenleri ve konak antikorları için immünoassayleri eklemiş, PCR'ın yükselişi, ribozomal bölgelerin DNA dizilemesi ve MALDI-TOF kütle spektrometrisi, tanımlamayı moleküler ve proteomik hassasiyete doğru dönüştürmüş, konsensüs tanımları ise yorumlamayı standartlaştırmıştır.
İlgili konular
Temel eserler
- donnelly-2020
- guarner-2011
- dehoog-2020
Sıkça sorulan sorular
- Mantar enfeksiyonunu teşhis etmek için neden birkaç farklı yöntem kullanılmaktadır?
- Her durum için tek bir yöntem hem hızlı hem de güvenilir değildir. Kültür, mikroskopi, antijen testleri ve moleküler testlerin her biri mantarın farklı bir yönünü tespit eder, bu nedenle bunların birleştirilmesi doğru ve zamanında tanı şansını artırmaktadır.
- Bir mantarı tespit etmek ile tanımlamak arasındaki fark nedir?
- Tespit, bir mantarın var olduğunu, örneğin mantar elemanlarını görerek veya bir antijeni tespit ederek belirler. Tanımlama ise, genellikle kültür morfolojisi, dizileme veya kütle spektrometrisi gerektiren cins veya türü adlandırmaktadır.