Diagnóstico Laboratorial e Técnicas de Cultura
O diagnóstico laboratorial e as técnicas de cultura são os métodos pelos quais o laboratório de microbiologia clínica detecta, cultiva e identifica as bactérias responsáveis por uma infecção. Esta área orienta o leitor através de todo o percurso diagnóstico, desde a recolha e transporte de uma amostra até ao cultivo, identificação e confirmação de um organismo por meios fenotípicos ou moleculares, juntamente com os sistemas de qualidade que tornam esses resultados fidedignos.
Definition
O diagnóstico laboratorial e as técnicas de cultura compreendem os métodos analíticos e pré-analíticos utilizados em bacteriologia clínica para recuperar, identificar e caracterizar patógenos bacterianos a partir de amostras clínicas, englobando cultura, identificação fenotípica, deteção molecular e garantia de qualidade.
Scope
A área examina os componentes do diagnóstico bacteriológico como um fluxo de trabalho conectado: seleção e processamento adequados de amostras, meios de cultura e condições de incubação que permitem a recuperação de organismos, identificação fenotípica e baseada em espectrometria de massa, amplificação de ácidos nucleicos e outros diagnósticos moleculares, e controlo de qualidade laboratorial. Estes são enquadrados como conceitos de referência para compreender como a evidência laboratorial é gerada, e não como um manual para solicitar ou interpretar testes num paciente individual.
Sub-topics
Core questions
- Como o laboratório recupera um patógeno bacteriano de uma amostra clínica?
- O que determina se um organismo cultivado é um patógeno, colonizador ou contaminante?
- Como as bactérias são identificadas uma vez recuperadas, e quais os métodos mais recentes que complementam ou substituem a cultura?
- Que sistemas de qualidade garantem que os resultados microbiológicos são precisos e reprodutíveis?
Key concepts
- Fases pré-analítica, analítica e pós-analítica
- Meios de cultura e condições de incubação
- Identificação fenotípica
- Espectrometria de massa por dessorção/ionização a laser assistida por matriz com tempo de voo (MALDI-TOF)
- Testes de amplificação de ácidos nucleicos
- Qualidade da amostra e contaminação
- Controlo de qualidade laboratorial e testes de proficiência
Mechanisms
O diagnóstico bacteriológico segue um fluxo de trabalho cuja validade depende de cada etapa. Uma amostra representativa do local da infecção é recolhida e transportada em condições que preservam organismos viáveis, depois inoculada em meios e incubada em atmosferas adequadas aos patógenos suspeitos. O crescimento é examinado e os isolados são identificados por reações fenotípicas ou, cada vez mais, por espectrometria de massa MALDI-TOF; métodos moleculares podem detetar organismos diretamente de amostras sem cultura prévia. Ao longo do processo, os procedimentos de controlo de qualidade verificam se os meios, reagentes e instrumentos funcionam como esperado, para que um resultado reportado reflita o paciente e não um artefacto laboratorial. Orientações autorizadas enquadram o laboratório e o clínico como parceiros cujas decisões conjuntas sobre o que recolher e testar determinam o rendimento diagnóstico (Baron 2013).
Clinical relevance
Os resultados produzidos por estes métodos sustentam grande parte da evidência utilizada para atribuir infecções a organismos específicos e para monitorizar a resistência. A compreensão do percurso diagnóstico ajuda os leitores a avaliar por que uma cultura pode ser negativa apesar da infecção, por que uma cultura positiva pode representar contaminação e como as ferramentas moleculares e proteómicas mais recentes alteram o tempo de resposta do diagnóstico. A área descreve como a evidência laboratorial é gerada e não constitui uma base para decisões individuais de diagnóstico ou tratamento.
Evidence & guidelines
Orientações de consenso da Infectious Diseases Society of America e da American Society for Microbiology descrevem a seleção apropriada de amostras e a utilização laboratorial para o diagnóstico de doenças infecciosas (Baron 2013). Textos de referência como o Manual of Clinical Microbiology codificam métodos padrão de cultura e identificação (Jorgensen 2015), e revisões têm mapeado a mudança para diagnósticos moleculares e proteómicos mais rápidos (Caliendo 2013).
History
A bacteriologia diagnóstica surgiu dos métodos de cultura do final do século XIX dos primeiros microbiologistas e amadureceu ao longo do século XX em esquemas fenotípicos padronizados. O final do século XX e o início do século XXI trouxeram a amplificação de ácidos nucleicos e a espectrometria de massa MALDI-TOF, que reduziram os tempos de identificação e, em alguns contextos, permitiram a deteção sem cultura (Caliendo 2013).
Related topics
Seminal works
- baron-2013
- jorgensen-2015
- caliendo-2013
Frequently asked questions
- O que faz realmente o laboratório de microbiologia clínica?
- Recupera, identifica e caracteriza microrganismos a partir de amostras clínicas, utilizando cultura, identificação fenotípica e molecular, e sistemas de qualidade para que os resultados reflitam de forma fiável o que está presente no paciente.
- A cultura ainda é necessária agora que existem testes moleculares?
- A cultura permanece central porque recupera um isolado viável para testes adicionais, mas os métodos moleculares e de espectrometria de massa complementam-na cada vez mais, acelerando a identificação e, para alguns alvos, detetando organismos diretamente de amostras.