ScholarGate
Assistent
Process / pipelineBioinformatics / omics

Bayesiansk analyse av kopitallvariasjon

Bayesiansk analyse av kopitallvariasjon (CNV) er et sannsynlighetsbasert rammeverk for å detektere genomiske segmenter der en persons DNA-kopitall avviker fra den diploide normalen. Ved å plassere prior-fordelinger over kopitalltilstander og oppdatere dem med bevis fra array CGH, SNP-array eller sekvenseringslesedybde, gir tilnærmingen posterior-sannsynligheter for hver kopitalltilstand langs genomet, noe som gir statistisk prinsipiell usikkerhetskvantifisering som frekventistiske segmenteringsmetoder mangler.

Åpne i MethodMindSnartVideoSnartDownload slides

Les hele metoden

Kun for medlemmer

Logg inn med en gratis konto for å lese denne delen.

Logg inn

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Kilder

  1. Colella, S., Yau, C., Taylor, J. M., Mirza, G., Butler, H., Clouston, P., Bassett, A. S., Seller, A., Holmes, C. C., & Ragoussis, J. (2007). QuantiSNP: an Objective Bayes Hidden-Markov Model to detect and accurately map copy number variation using SNP genotyping data. Nucleic Acids Research, 35(6), 2013–2025. DOI: 10.1093/nar/gkm076
  2. Fridlyand, J., Snijders, A. M., Pinkel, D., Albertson, D. G., & Jain, A. N. (2004). Hidden Markov models approach to the analysis of array CGH data. Journal of Multivariate Analysis, 90(1), 132–153. DOI: 10.1016/j.jmva.2004.02.008

Slik siterer du denne siden

ScholarGate. (2026, June 3). Bayesian Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/no/bioinformatics/bayesian-copy-number-variation-analysis

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side
ScholarGateBayesian Copy Number Variation Analysis (Bayesian Copy Number Variation Analysis). Hentet 2026-06-15 fra https://scholargate.app/no/bioinformatics/bayesian-copy-number-variation-analysis · Datasett: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026