Analisis Pengayaan Set Gen (GSEA)
Analisis Pengayaan Set Gen (GSEA) ialah kaedah pengiraan yang menentukan sama ada set gen yang telah ditetapkan — yang mewakili laluan, proses atau fungsi biologi — menunjukkan perbezaan yang signifikan secara statistik dan terselaras antara dua keadaan biologi. Berbeza dengan penapisan perubahan lipatan ringkas, GSEA beroperasi pada semua gen yang diukur yang diperingkat mengikut metrik korelasi, mengesan anjakan halus tetapi konsisten di seluruh laluan keseluruhan walaupun tiada gen tunggal melepasi ambang signifikan. GSEA ialah kaedah pengiraan yang menentukan sama ada satu set gen yang telah ditetapkan, yang mewakili laluan biologi, proses atau fungsi, menunjukkan perbezaan yang signifikan secara statistik dan terselaras antara dua keadaan biologi.
Baca kaedah sepenuhnya
Log masuk dengan akaun percuma untuk membaca bahagian ini.
Peta kaedah
Kejiranan kaedah berkaitan — pilih satu nod untuk meneroka.
+27 lagi
Sumber
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Mootha, V. K., Lindgren, C. M., Eriksson, K. F., Subramanian, A., Sihag, S., Lehar, J., Puigserver, P., Carlsson, E., Ridderstrale, M., Laurila, E., Houstis, N., Daly, M. J., Patterson, N., Mesirov, J. P., Golub, T. R., Tamayo, P., Spiegelman, B., Lander, E. S., Hirschhorn, J. N., Altshuler, D., & Groop, L. C. (2003). PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes. Nature Genetics, 34(3), 267–273. DOI: 10.1038/ng1180 ↗
Cara memetik halaman ini
ScholarGate. (2026, June 3). Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ms/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis
Kaedah yang mana?
Letakkan kaedah ini di sebelah kaedah yang paling rapat dengannya dan baca secara bersebelahan — perpustakaan menyusun buku di atas meja; pilihan terletak pada anda.
- Analisis Pengayaan Set Gen Multi-OmikBioinformatik↔ banding
- Analisis Pengayaan Set Gen Berasaskan RangkaianBioinformatik↔ banding
- Analisis Pengayaan LaluanBioinformatik↔ banding
- Analisis Ungkapan Perbezaan RNA-seqBioinformatik↔ banding
- Analisis scRNA-seqBioinformatik↔ banding
Dirujuk oleh
Terjumpa masalah pada halaman ini? Laporkan atau cadangkan pembetulan →