Pretraga HMMER profila
Pretraga HMMER profila identificira udaljene homologe proteinskih sekvenci koristeći probabilističke modele proteinskih porodica, poznate kao profili skrivenih Markovljevih modela (HMM). Razvijena od strane Eddyja i suradnika, ova metoda bilježi obrasce varijacije sekvenci unutar proteinskih porodica i detektira homologe s daleko većom osjetljivošću nego matrice težinskih pozicija ili parne poravnave.
Pročitajte cijelu metodu
Prijavite se besplatnim računom kako biste pročitali ovaj odjeljak.
Karta metoda
Okruženje srodnih metoda — odaberite čvor za istraživanje.
Izvori
- Krogh, A., Brown, M., Mian, I. S., Sjölander, K., & Haussler, D. (1994). Hidden Markov models in computational biology: applications to protein modeling. Journal of Molecular Biology, 235(5), 1501-1531. DOI: 10.1006/jmbi.1994.1104 ↗
- Eddy, S. R. (1998). Profile hidden Markov models. Bioinformatics, 14(9), 755-763. DOI: 10.1093/bioinformatics/14.9.755 ↗
- Finn, R. D., Clements, J., & Eddy, S. R. (2011). HMMER web server: interactive sequence similarity searching. Nucleic Acids Research, 39(Web Server issue), W29-W37. DOI: 10.1093/nar/gkr367 ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Hidden Markov Model Profile Search for Sequence Homology. ScholarGate. https://scholargate.app/hr/bioinformatics/hmmer-profile-search
Koja metoda?
Postavite ovu metodu uz njoj najsrodnije i pročitajte ih jednu uz drugu — knjižnica vam knjige stavlja na stol; izbor je na vama.
- Rekonstrukcija u krio-elektronskoj mikroskopijiBioinformatika↔ usporedi
- Metagenomsko grupisanjeBioinformatika↔ usporedi
- Molekularno spajanjeBioinformatika↔ usporedi
Citirana u
Similar methods
Uočili ste pogrešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravak →