Épidémiologie et fardeau de la résistance aux antimicrobiens

Ce domaine étudie comment la résistance aux agents antimicrobiens apparaît dans les populations microbiennes, comment les organismes résistants se propagent entre les hôtes et dans différents contextes, comment ils sont suivis par la surveillance, et l'ampleur des dommages qu'ils causent aux populations et aux systèmes de santé. Il applique les outils de l'épidémiologie à un problème microbiologique, en se demandant non seulement pourquoi un organisme est résistant, mais aussi où, à quelle fréquence et avec quelles conséquences la résistance se manifeste.

Definition

L'épidémiologie et le fardeau de la résistance aux antimicrobiens désignent l'étude de la distribution, des déterminants et des conséquences au niveau populationnel des organismes résistants aux antimicrobiens, englobant leur émergence et leur sélection, leur transmission, leur surveillance, et l'estimation de leur impact en termes de morbidité, de mortalité et d'économie.

Scope

Ce domaine oriente le lecteur vers quatre questions interdépendantes : comment les organismes résistants émergent et sont sélectionnés, comment ils sont transmis dans les milieux de soins et communautaires, comment les systèmes de surveillance mesurent la résistance, et comment le fardeau qui en résulte est quantifié en termes de morbidité, de mortalité et de coût. Il présente la résistance aux antimicrobiens comme un phénomène de niveau populationnel et sert de complément épidémiologique aux sujets mécanistiques et de gestion (stewardship) abordés ailleurs dans le sous-domaine de la résistance aux antimicrobiens.

Sub-topics

• Fardeau mondial : morbidité, mortalité et impact économique
• Émergence et sélection des organismes résistants
• Systèmes de surveillance et de suivi de la résistance
• Transmission en milieux de soins et communautaires

Core questions

• Comment les organismes résistants émergent-ils et sont-ils sélectionnés au sein des populations microbiennes ?
• Par quelles voies les organismes résistants se propagent-ils dans les hôpitaux et dans la communauté ?
• Comment la résistance est-elle mesurée et suivie à travers les laboratoires, les pays et le temps ?
• Quelle est l'ampleur du fardeau humain et économique attribuable à la résistance aux antimicrobiens ?

Key concepts

• Pression de sélection due à l'utilisation des antimicrobiens
• Transfert horizontal de gènes et éléments génétiques mobiles
• Colonisation versus infection
• Réservoirs et voies de transmission
• Surveillance de la résistance et antibiogrammes
• Mortalité attribuable et années de vie ajustées sur l'incapacité (DALY)
• Approche « Une seule santé » (One Health) à travers les compartiments humain, animal et environnemental

Mechanisms

La résistance devient un problème épidémiologique par l'interaction de la sélection et de la propagation. L'exposition aux antimicrobiens, y compris à des concentrations subinhibitrices, favorise les organismes qui portent ou acquièrent des déterminants de résistance, tandis que les éléments génétiques mobiles permettent à ces déterminants de se déplacer entre les souches et les espèces. Les organismes sélectionnés se disséminent ensuite par contact, via des environnements contaminés, les chaînes alimentaires et le déplacement de personnes colonisées, de sorte que les événements de sélection locaux peuvent devenir des problèmes régionaux ou mondiaux. La surveillance mesure la fréquence de résistance qui en résulte, et l'estimation du fardeau traduit cette fréquence en nombre de décès, de maladies et de coûts.

Clinical relevance

La compréhension de l'épidémiologie et du fardeau de la résistance est essentielle à la prévention des infections, aux décisions de thérapie empirique au niveau populationnel et aux politiques d'utilisation des antimicrobiens. Cependant, ce domaine décrit comment la résistance est distribuée et quantifiée plutôt que d'offrir des directives de traitement individuelles. Il explique pourquoi les schémas de résistance locaux sont importants pour le raisonnement clinique et pourquoi les données de surveillance éclairent les réponses institutionnelles et nationales.

Epidemiology

La résistance aux antimicrobiens est un phénomène mondial présentant des variations géographiques et spécifiques aux pathogènes marquées. Les travaux de modélisation attribuent un nombre important et croissant de décès à la résistance bactérienne dans le monde, le fardeau le plus lourd se trouvant dans les régions ayant des capacités de diagnostic et de gestion (stewardship) limitées, et concentré parmi un petit ensemble de pathogènes prioritaires. Les facteurs déterminants couvrent la médecine humaine, l'agriculture et l'environnement, ce qui motive une approche « Une seule santé » (One Health) pour la mesure et le contrôle.

History

La résistance a été observée peu après l'introduction des antimicrobiens en usage clinique au milieu du XXe siècle, mais sa conceptualisation en tant que fardeau populationnel mesurable a mûri plus tard, à mesure que des systèmes de surveillance nationaux et internationaux étaient mis en place et que des études de modélisation commençaient à estimer la mortalité attribuable. La politique internationale s'est cristallisée autour de plans d'action coordonnés qui ont placé la surveillance et l'estimation du fardeau au centre de la réponse.

Seminal works

• murray-2022
• holmes-2016
• laxminarayan-2013

Frequently asked questions

En quoi ce domaine diffère-t-il des mécanismes de résistance ?

Les sujets mécanistiques expliquent comment un organisme unique résiste à un médicament au niveau moléculaire ; ce domaine étudie la résistance comme un phénomène de population — sa fréquence, sa propagation, son suivi et l'ampleur des dommages qu'elle cause.

Pourquoi la résistance aux antimicrobiens est-elle décrite selon une approche « Une seule santé » (One Health) ?

Parce que la résistance se déplace entre les compartiments humain, animal et environnemental, son émergence, sa transmission et son fardeau ne peuvent être pleinement compris ou mesurés uniquement dans le cadre de la médecine humaine.