شناسایی و مقاومت مایکوباکتریایی
شناسایی مایکوباکتریایی و آزمایش مقاومت، روشهای آزمایشگاهی هستند که برای تشخیص مایکوباکتریوم توبرکلوزیس و سایر مایکوباکتریها، شناسایی آنها تا سطح گونه، و تعیین حساسیت آنها به داروهای ضد مایکوباکتریایی استفاده میشوند. از آنجا که مایکوباکتریها به کندی رشد میکنند، این حوزه میکروسکوپی و کشت را با سنجشهای مولکولی سریع ترکیب میکند که میتوانند هم ارگانیسم و هم نشانگرهای کلیدی مقاومت را شناسایی کنند.
Definition
شناسایی مایکوباکتریایی، تشخیص آزمایشگاهی و شناسایی در سطح گونه مایکوباکتریها از یک نمونه بالینی است؛ آزمایش مقاومت، تعیین حساسیت یک ایزوله مایکوباکتریایی به عوامل ضد مایکوباکتریایی، با روشهای فنوتیپی یا مولکولی است.
Scope
این مدخل میکروسکوپی اسید-فست، کشت مایکوباکتریایی، شناسایی گونه، آزمایش حساسیت دارویی فنوتیپی و مولکولی، و تشخیص مولکولی سریع مقاومت مانند مقاومت به ریفامپین در سل را پوشش میدهد. این موارد را به عنوان روشهای آزمایشگاهی بررسی میکند و رژیمهای درمانی یا دوزبندی را ارائه نمیدهد.
Core questions
- آیا مایکوباکتریها در این نمونه وجود دارند، و آیا ارگانیسم مایکوباکتریوم توبرکلوزیس یا یک گونه غیر توبرکلوزی است؟
- کدام روشها - میکروسکوپی اسید-فست، کشت، سنجشهای مولکولی، یا شناسایی پروتئومیک - مایکوباکتریها را تشخیص و شناسایی میکنند؟
- آیا ایزوله به داروهای کلیدی ضد مایکوباکتریایی مقاوم است، و چگونه این به صورت فنوتیپی یا مولکولی تعیین میشود؟
- چگونه رشد آهسته مایکوباکتریها و سرعت سنجشهای مولکولی بر گردش کار آزمایشگاهی تأثیر میگذارد؟
Key concepts
- میکروسکوپی اسید-فست (زیل-نلسون، اورامین)
- کشت مایکوباکتریایی (محیطهای جامد و مایع)
- کمپلکس مایکوباکتریوم توبرکلوزیس در مقابل مایکوباکتریهای غیر توبرکلوزی
- آزمایش حساسیت دارویی فنوتیپی
- تشخیص مولکولی مقاومت (مثلاً مقاومت به ریفامپین)
- تکثیر اسید نوکلئیک برای تشخیص مستقیم
- پروب خطی و سنجشهای مبتنی بر کارتریج
- رشد آهسته و زمان چرخش
Mechanisms
تشخیص مایکوباکتریها با میکروسکوپی اسید-فست آغاز میشود، که دیواره سلولی غنی از لیپید را رنگآمیزی میکند، و با کشت در محیطهای جامد یا مایع که، به دلیل رشد آهسته مایکوباکتریها، ممکن است هفتهها طول بکشد. شناسایی گونه، کمپلکس مایکوباکتریوم توبرکلوزیس را از مایکوباکتریهای غیر توبرکلوزی با استفاده از پروبهای مولکولی، توالییابی، یا روشهای پروتئومیک مانند طیفسنجی جرمی (Clark et al., 2013) متمایز میکند. آزمایش حساسیت دارویی به صورت فنوتیپی با رشد در حضور داروها یا، به طور فزاینده، با تشخیص مولکولی جهشهای مرتبط با مقاومت انجام میشود. تکثیر اسید نوکلئیک مبتنی بر کارتریج خودکار میتواند M. tuberculosis و مقاومت به ریفامپین را مستقیماً از یک نمونه در عرض چند ساعت به جای هفتهها مورد نیاز برای آزمایش مبتنی بر کشت تشخیص دهد (Boehme et al., 2010)، و PCR بلادرنگ به طور گستردهتری از تشخیص مولکولی مستقیم در آزمایشگاه پشتیبانی میکند (Espy et al., 2006). بررسیهای جامع این روشهای آزمایشگاهی را در چشمانداز وسیعتر تشخیص و نظارت بر سل قرار میدهند (Pai et al., 2016).
Clinical relevance
شناسایی مایکوباکتریها و تشخیص مقاومت دارویی اطلاعاتی را تولید میکند که برای استدلال بالینی در مورد سل و بیماری مایکوباکتریایی غیر توبرکلوزی و برای کنترل بهداشت عمومی حیاتی است. این مدخل نحوه تولید این نتایج آزمایشگاهی و محدودیتهای آنها را توضیح میدهد؛ این یک ماده مرجع است و رژیمهای ضد مایکوباکتریایی یا دوزبندی برای یک فرد را تجویز نمیکند.
Epidemiology
آزمایش آزمایشگاهی مایکوباکتریایی جزء لاینفک کنترل سل است: تشخیص مولکولی سریع ارگانیسم و مقاومت، مسیر تشخیص سل مقاوم به دارو را کوتاه میکند و به نظارت کمک میکند (Boehme et al., 2010). بررسیهای سل بر نقش تشخیص در اپیدمیولوژی جهانی و مدیریت بیماری تأکید دارند (Pai et al., 2016).
History
تشخیص مایکوباکتریایی برای بیش از یک قرن بر میکروسکوپی اسید-فست و کشت آهسته متکی بود، با آزمایش حساسیت دارویی فنوتیپی که بعدها اضافه شد. معرفی تکثیر اسید نوکلئیک و، به ویژه، سنجشهای خودکار مبتنی بر کارتریج که قادر به گزارش M. tuberculosis و مقاومت به ریفامپین مستقیماً از خلط در عرض چند ساعت بودند، تغییر عمدهای در عملکرد آزمایشگاهی ایجاد کرد (Boehme et al., 2010)، که در گسترش وسیعتر میکروبیولوژی مولکولی قرار گرفت (Espy et al., 2006).
Related topics
Seminal works
- boehme-2010
- pai-2016
- espy-2006
Frequently asked questions
- چرا آزمایش مایکوباکتریایی هم به کشت و هم به روشهای مولکولی متکی است؟
- مایکوباکتریها به کندی رشد میکنند، بنابراین شناسایی مبتنی بر کشت و آزمایش حساسیت ممکن است هفتهها طول بکشد. سنجشهای مولکولی ارگانیسم و نشانگرهای کلیدی مقاومت، مانند مقاومت به ریفامپین، را مستقیماً از یک نمونه در عرض چند ساعت تشخیص میدهند و مکمل کشت هستند (Boehme et al., 2010).
- چه چیزی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس را از مایکوباکتریهای غیر توبرکلوزی در آزمایشگاه متمایز میکند؟
- هر دو اسید-فست هستند، بنابراین میکروسکوپی به تنهایی نمیتواند آنها را از هم جدا کند؛ شناسایی در سطح گونه از پروبهای مولکولی، توالییابی، یا روشهای پروتئومیک برای تمایز کمپلکس M. tuberculosis از مایکوباکتریهای غیر توبرکلوزی استفاده میکند (Clark et al., 2013).