بندیسازی متاژنومی
بندیسازی متاژنومی (Metagenomic binning) کنتیگهای مونتاژ شده از جوامع میکروبی پیچیده را به بخشهای ژنومی مجزا تقسیم میکند که هر یک نمایانگر یک ارگانیسم یا سویه منفرد است. این رویکرد که توسط بنفیلد و همکارانش پیشگام شد، ژنومهای تکارگانیسمی (ژنومهای مونتاژ شده از متاژنوم یا MAGs) را از نمونههای محیطی بدون نیاز به جداسازی کشتشده، جدا میکند.
مطالعهٔ کامل روش
برای خواندن این بخش با حساب رایگان وارد شوید.
نقشهٔ روش
همسایگی روشهای مرتبط — برای کاوش، یک گره را برگزینید.
منابع
- Kang, D. D., Froula, J., Egan, R., & Wang, Z. (2015). MetaBAT, an efficient tool for accurately reconstructing single genomes from complex microbial communities. PeerJ, 3, e1165. DOI: 10.7717/peerj.1165 ↗
- Jain, C., Rodriguez-R, L. M., Phillippy, A. M., Konstantinidis, K. T., & Aluru, S. (2018). High throughput ANI analysis of 90K prokaryotic genomes reveals clear species boundaries. Nature Communications, 9(1), 4045. DOI: 10.1038/s41467-018-07641-9 ↗
- Sieber, C. M. K., Probst, A. J., Sharrar, A., Thomas, B. C., Hess, M., Tringe, S. G., & Banfield, J. F. (2018). Recovery of genomes from metagenomes via a dereplication, aggregation and scoring strategy. Nature Microbiology, 3(7), 836-843. DOI: 10.1038/s41564-018-0171-1 ↗
نحوهٔ استناد به این صفحه
ScholarGate. (2026, June 3). Metagenome Assembly and Genome Binning. ScholarGate. https://scholargate.app/fa/bioinformatics/metagenomic-binning
کدام روش؟
این روش را در کنار نزدیکترین روشهای خویشاوندش بگذارید و آنها را کنار هم بخوانید — کتابخانه کتابها را روی میز میگشاید؛ انتخاب با شماست.
- تحلیل غربالگری CRISPRزیستاطلاعاتی↔ مقایسه
- مونتاژ دی نوو ترانسکریپتومزیستاطلاعاتی↔ مقایسه
- جستجوی پروفایل HMMERزیستاطلاعاتی↔ مقایسه
ارجاعشده در
در این صفحه مشکلی دیدید؟ گزارش دهید یا اصلاحی پیشنهاد کنید →