Biological Pathway Enrichment Analysis
تصور کنید ۳۰۰ ژن را شناسایی کردهاید که در یک وضعیت بیماری بهطور قابلتوجهی تغییر میکنند. خواندن نام هر ۳۰۰ ژن، اطلاعات کمی به شما میدهد. تحلیل غنیسازی مسیر میپرسد: آیا هیچ فرآیند بیولوژیکی — مانند «پاسخ التهابی» یا «تنظیم چرخه سلولی» — در این ۳۰۰ ژن بیشتر از آنچه انتظار دارید اگر صرفاً ۳۰۰ ژن را بهطور تصادفی از ژنوم انتخاب میکردید، ظاهر میشود؟ اگر ژنهای التهابی ۵ برابر بیشتر از پیشبینی تصادفی ظاهر شوند، آن مسیر «غنیشده» است و نشان میدهد که در آن وضعیت نقش دارد. این روش، فهرستی گیجکننده از اجزای مولکولی را به داستانی فشرده و قابل تفسیر درباره اینکه کدام مکانیسمهای سلولی فعال یا سرکوب شدهاند، تبدیل میکند.
مطالعهٔ کامل روش
برای خواندن این بخش با حساب رایگان وارد شوید.
نقشهٔ روش
همسایگی روشهای مرتبط — برای کاوش، یک گره را برگزینید.
+43 مورد دیگر
منابع
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Alexa, A., Rahnenführer, J., & Lengauer, T. (2006). Improved scoring of functional groups from gene expression data by decorrelating GO graph structure. Bioinformatics, 22(13), 1600–1607. DOI: 10.1093/bioinformatics/btl140 ↗
نحوهٔ استناد به این صفحه
ScholarGate. (2026, June 3). Biological Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fa/bioinformatics/pathway-enrichment-analysis
کدام روش؟
این روش را در کنار نزدیکترین روشهای خویشاوندش بگذارید و آنها را کنار هم بخوانید — کتابخانه کتابها را روی میز میگشاید؛ انتخاب با شماست.
- تحلیل غنیسازی مجموعههای ژنی (GSEA)زیستاطلاعاتی↔ مقایسه
- تحلیل متابولومیکسزیستاطلاعاتی↔ مقایسه
- تحلیل غنیسازی مسیر مبتنی بر شبکهزیستاطلاعاتی↔ مقایسه
- تجزیه و تحلیل پروتئومیکسزیستاطلاعاتی↔ مقایسه
- تحلیل بیان افتراقی RNA-seqزیستاطلاعاتی↔ مقایسه
- تجزیه و تحلیل توالییابی RNA تکسلولیزیستاطلاعاتی↔ مقایسه
ارجاعشده در
در این صفحه مشکلی دیدید؟ گزارش دهید یا اصلاحی پیشنهاد کنید →