تحلیل غنیسازی مجموعههای ژنی (GSEA)
تحلیل غنیسازی مجموعههای ژنی (GSEA) یک روش محاسباتی است که تعیین میکند آیا یک مجموعه از پیش تعریفشده ژنها — که نمایانگر یک مسیر بیولوژیکی، فرآیند یا عملکرد است — تفاوتهای هماهنگ و از نظر آماری معنیدار بین دو وضعیت بیولوژیکی نشان میدهد. برخلاف فیلتر کردن ساده تغییرات لگاریتمی (fold-change)، GSEA بر روی تمام ژنهای اندازهگیریشده که بر اساس معیاری از همبستگی رتبهبندی شدهاند، عمل میکند و تغییرات ظریف اما پایدار را در سراسر یک مسیر کامل تشخیص میدهد، حتی زمانی که هیچ ژن منفردی از آستانه معنیداری عبور نکند.
مطالعهٔ کامل روش
برای خواندن این بخش با حساب رایگان وارد شوید.
نقشهٔ روش
همسایگی روشهای مرتبط — برای کاوش، یک گره را برگزینید.
+27 مورد دیگر
منابع
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Mootha, V. K., Lindgren, C. M., Eriksson, K. F., Subramanian, A., Sihag, S., Lehar, J., Puigserver, P., Carlsson, E., Ridderstrale, M., Laurila, E., Houstis, N., Daly, M. J., Patterson, N., Mesirov, J. P., Golub, T. R., Tamayo, P., Spiegelman, B., Lander, E. S., Hirschhorn, J. N., Altshuler, D., & Groop, L. C. (2003). PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes. Nature Genetics, 34(3), 267–273. DOI: 10.1038/ng1180 ↗
نحوهٔ استناد به این صفحه
ScholarGate. (2026, June 3). Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fa/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis
کدام روش؟
این روش را در کنار نزدیکترین روشهای خویشاوندش بگذارید و آنها را کنار هم بخوانید — کتابخانه کتابها را روی میز میگشاید؛ انتخاب با شماست.
- تحلیل غنیسازی مجموعههای ژنی چند-اُمیکسزیستاطلاعاتی↔ مقایسه
- تحلیل غنیسازی مجموعههای ژنی مبتنی بر شبکهزیستاطلاعاتی↔ مقایسه
- Pathway Enrichment Analysisزیستاطلاعاتی↔ مقایسه
- تحلیل بیان افتراقی RNA-seqزیستاطلاعاتی↔ مقایسه
- تجزیه و تحلیل توالییابی RNA تکسلولیزیستاطلاعاتی↔ مقایسه
ارجاعشده در
در این صفحه مشکلی دیدید؟ گزارش دهید یا اصلاحی پیشنهاد کنید →