تحلیل غنیسازی مسیر مبتنی بر شبکه
تحلیل غنیسازی مسیر مبتنی بر شبکه، شبکههای برهمکنش مولکولی — برهمکنش پروتئین-پروتئین، گرافهای سیگنالینگ، یا شبکههای تنظیمی ژنی — را با اندازهگیریهای اُمیکس یکپارچه میکند تا مسیرهای بیولوژیکی را که بهطور هماهنگ در یک وضعیت تغییر یافتهاند، شناسایی کند. برخلاف رویکردهای کلاسیک غنیسازی بیش از حد یا غنیسازی مجموعههای ژنی که ژنهای مسیر را بهعنوان لیستهای مستقل در نظر میگیرند، این خانواده از روشها سیگنالها را در طول یالهای شبکه منتشر میکنند، توپوگرافی برهمکنشها را ثبت کرده و ماژولهای مختل شدهای را کشف میکنند که غنیسازی لیست مسطح از دست میدهد.
مطالعهٔ کامل روش
برای خواندن این بخش با حساب رایگان وارد شوید.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
منابع
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link ↗
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182 ↗
نحوهٔ استناد به این صفحه
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fa/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- تحلیل غنیسازی مجموعههای ژنی (GSEA)زیستاطلاعاتی↔ compare
ارجاعشده در
در این صفحه مشکلی دیدید؟ گزارش دهید یا اصلاحی پیشنهاد کنید →