Process / pipelineBioinformatics / omics

تحلیل تغییرات تعداد کپی مبتنی بر شبکه

تحلیل تغییرات تعداد کپی (CNV) مبتنی بر شبکه، داده‌های CNV در سطح ژنوم را با شبکه‌های تعامل بیولوژیکی — مانند تعامل پروتئین-پروتئین (PPI) یا شبکه‌های مسیر — ادغام می‌کند تا مناطق از نظر عملکردی منسجم، ژن‌های راننده، و زیرشبکه‌های تغییریافته‌ای را شناسایی کند که تنها با فراخوانی CNV خام قابل تشخیص نیستند. با انتشار سیگنال‌های CNV از طریق گراف شبکه، این روش عدم تعادل‌های دوز ژنومی هماهنگ را آشکار می‌سازد که به عملکردهای بیولوژیکی مشترک همگرا می‌شوند، و این امر آن را به ویژه در ژنومیک سرطان و مطالعات بیماری‌های نادر قدرتمند می‌سازد.

باز کردن در MethodMindبه‌زودیویدیوبه‌زودیDownload slides

مطالعهٔ کامل روش

ویژهٔ اعضا

برای خواندن این بخش با حساب رایگان وارد شوید.

ورود

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

منابع

  1. Vandin, F., Upfal, E., & Raphael, B. J. (2012). De novo discovery of mutated driver pathways in cancer. Genome Research, 22(2), 375–385. DOI: 10.1101/gr.120477.111
  2. Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations across pathways and protein complexes. Nature Genetics, 47(2), 106–114. DOI: 10.1038/ng.3168

نحوهٔ استناد به این صفحه

ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fa/bioinformatics/network-based-copy-number-variation-analysis

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side
ScholarGateNetwork-based copy number variation analysis (Network-Based Copy Number Variation Analysis). بازیابی‌شده در 2026-06-15 از https://scholargate.app/fa/bioinformatics/network-based-copy-number-variation-analysis · مجموعه‌داده: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026