Tìm kiếm Hồ sơ HMMER
Tìm kiếm hồ sơ HMMER xác định các họ hàng trình tự protein xa bằng cách sử dụng các mô hình xác suất của các họ protein, được gọi là Mô hình Markov Ẩn hồ sơ (HMM). Được phát triển bởi Eddy và các đồng nghiệp, phương pháp này nắm bắt các mẫu biến đổi trình tự trong các họ protein và phát hiện các họ hàng với độ nhạy cao hơn nhiều so với ma trận trọng số vị trí hoặc căn chỉnh cặp.
Đọc toàn bộ phương pháp
Đăng nhập bằng tài khoản miễn phí để đọc phần này.
Bản đồ phương pháp
Lân cận của các phương pháp liên quan — chọn một nút để khám phá.
Nguồn tài liệu
- Krogh, A., Brown, M., Mian, I. S., Sjölander, K., & Haussler, D. (1994). Hidden Markov models in computational biology: applications to protein modeling. Journal of Molecular Biology, 235(5), 1501-1531. DOI: 10.1006/jmbi.1994.1104 ↗
- Eddy, S. R. (1998). Profile hidden Markov models. Bioinformatics, 14(9), 755-763. DOI: 10.1093/bioinformatics/14.9.755 ↗
- Finn, R. D., Clements, J., & Eddy, S. R. (2011). HMMER web server: interactive sequence similarity searching. Nucleic Acids Research, 39(Web Server issue), W29-W37. DOI: 10.1093/nar/gkr367 ↗
Cách trích dẫn trang này
ScholarGate. (2026, June 3). Hidden Markov Model Profile Search for Sequence Homology. ScholarGate. https://scholargate.app/vi/bioinformatics/hmmer-profile-search
Phương pháp nào?
Đặt phương pháp này bên cạnh những phương pháp gần gũi nhất với nó và đọc chúng song song — thư viện bày sách lên bàn; lựa chọn là của bạn.
- Tái tạo cấu trúc bằng kính hiển vi điện tử lạnhTin sinh học↔ so sánh
- Phân loại MetagenomeTin sinh học↔ so sánh
- Chụp phân tửTin sinh học↔ so sánh
Được tham chiếu bởi
Similar methods
Phát hiện lỗi trên trang này? Báo cáo hoặc đề xuất chỉnh sửa →