Căn chỉnh chuỗi Bayes — Căn chỉnh xác suất với định lượng độ bất định

Căn chỉnh chuỗi Bayes xem việc căn chỉnh các chuỗi sinh học (DNA, RNA hoặc protein) như một bài toán suy luận xác suất thay vì tối ưu hóa tất định. Thay vì trả về một kết quả căn chỉnh tốt nhất duy nhất, nó lấy mẫu từ một phân phối hậu nghiệm trên tất cả các kết quả căn chỉnh khả thi dựa trên một mô hình thay thế và các tiên nghiệm về phạt khoảng trắng, do đó định lượng được độ bất định của việc căn chỉnh. Nó đặc biệt có giá trị khi các phân tích hạ nguồn như suy luận phát sinh loài hoặc chú giải chức năng nhạy cảm với lỗi căn chỉnh.