Yaygın Direnç Kalıplarının Fenotipik Tespiti
Direnç kalıplarının fenotipik tespiti, bir organizmayı sadece duyarlı veya dirençli olarak sınıflandırmanın ötesinde, organizma tarafından ifade edilen spesifik, klinik olarak önemli direnç mekanizmalarını tanımak için büyüme tabanlı ve biyokimyasal testler kullanmaktadır. Klasik örnekler arasında geniş spektrumlu beta-laktamazların (ESBL'ler), karbapenemazların ve stafilokoklarda metisilin direncinin tespiti yer almaktadır.
Tanım
Fenotipik direnç tespiti, bir organizmanın belirli bir beta-laktamaz veya karbapenemaz üretimi gibi özel bir direnç mekanizmasını ifade ettiğini göstermek için büyüme tabanlı, sinerji veya biyokimyasal testlerin kullanılmasıdır; bu, sadece duyarlılık kategorisini değil, mekanizmayı ayırt etmeyi amaçlamaktadır.
Kapsam
Bu madde, yaygın direnç kalıplarını doğrulamak için başlıca fenotipik stratejileri kapsamaktadır: ESBL'ler için kombinasyon-disk ve çift-disk sinerji testleri, Carba NP ve karbapenem inaktivasyon yöntemleri gibi biyokimyasal ve büyüme tabanlı karbapenemaz testleri ve metisilin direnci için sefoksitin bazlı tarama. Bu testlerin neyi gösterdiğini ve sınırlılıklarını açıklamaktadır ve tedavi rehberliği yerine referans materyal niteliğindedir.
Temel sorular
- Bu organizma, ESBL veya karbapenemaz gibi spesifik bir direnç mekanizmasını ifade etmekte midir?
- Hangi fenotipik testler bu mekanizmayı doğrulayabilir ve sonuçları ne anlama gelmektedir?
- Fenotipik tespitin moleküler doğrulama ile karşılaştırıldığında sınırlılıkları nelerdir?
Anahtar kavramlar
- Geniş spektrumlu beta-laktamaz (ESBL) tespiti
- Çift-disk sinerji ve kombinasyon-disk testleri
- Karbapenemaz tespiti (Carba NP, karbapenem inaktivasyon yöntemi)
- Metisilin direnci için sefoksitin taraması
- İndüklenebilir klindamisin direnci (D-testi)
- Doğrulayıcı ve tarama testleri
- Fenotip-genotip uyumsuzluğu
Mekanizmalar
Fenotipik testler, bir direnç mekanizmasını işlevsel etkisi aracılığıyla ortaya koymaktadır. ESBL tespiti, bir beta-laktamaz inhibitörü (klavulanik asit gibi) eklendiğinde, bir indikatör sefalosporine karşı duyarlılığın geri kazanılmasına dayanır; bu durum çift-disk veya kombinasyon-disk formatlarında sinerji olarak görülmektedir (paterson-2005). Karbapenemaz aktivitesi, Carba NP kolorimetrik testinde olduğu gibi bir karbapenemin hidrolizi yoluyla biyokimyasal olarak veya test organizmasına maruz bırakılan bir karbapenem diskinin duyarlı bir indikatör suşunu inhibe etme yeteneğini kaybettiği karbapenem inaktivasyon yöntemi gibi büyüme tabanlı testlerle tespit edilebilmektedir (van-der-zwaluw-2015; nordmann-2009). Stafilokoklarda metisilin direnci, mecA aracılı direnci daha iyi indükleyen ve tespit eden bir vekil olan sefoksitin kullanılarak fenotipik olarak taranmaktadır ve indüklenebilir makrolid-linkozamid direnci D-testi ile gösterilmektedir. Uzman kurallar, bu kalıpları yorumlamaya ve tutarsız sonuçları işaretlemeye yardımcı olmaktadır (leclercq-2013; clsi-m100).
Klinik önem
ESBL veya karbapenemaz üretimi gibi direnç fenotiplerini tanımak, enfeksiyon kontrolü, sürveyans ve antimikrobiyal yönetim için merkezi bir öneme sahiptir, çünkü bu mekanizmalar tüm ajan sınıflarını etkilemektedir. Bu madde, bu tür fenotiplerin laboratuvarda nasıl gösterildiğini referans bilgisi olarak tanımlamakta ve bireysel tanı veya reçeteleme rehberliği sağlamamaktadır.
Epidemiyoloji
Karbapenemaz üreten Enterobacterales ve ESBL üreticileri uluslararası alanda yayılmış olup, fenotipik tespitlerini laboratuvarlar ve sürveyans ağları için bir öncelik haline getirmiştir; bu mekanizmaların epidemiyolojisi, doğrulayıcı testlerin geliştirilmesini ve benimsenmesini şekillendirmiştir (nordmann-2009; paterson-2005).
Tarihçe
1980'lerden itibaren beta-laktam direnç mekanizmaları çeşitlendikçe, laboratuvarlar inhibitör tabanlı ESBL tespitiyle başlayarak fenotipik doğrulayıcı testler geliştirmiştir. 2000'li yıllarda karbapenemaz üreten organizmaların uluslararası alanda ortaya çıkışı, Carba NP testi gibi hızlı biyokimyasal ve büyüme tabanlı karbapenemaz testlerini ve daha sonra daha basit karbapenem inaktivasyon yöntemini teşvik etmiştir (paterson-2005; nordmann-2009; van-der-zwaluw-2015).
Tartışmalar
- Fenotipik ve moleküler doğrulama
- Fenotipik testler işlevsel aktiviteyi tespit etmektedir ancak spesifik geni tanımlayamayabilirken, moleküler testler her zaman ifade edilmeyen genleri tanımlamaktadır; karbapenemaz üretimi gibi mekanizmaları doğrulamak için uygun yöntem kombinasyonu ve sırası tartışılmaktadır.
- Zayıf ifade edilen mekanizmalar için duyarlılık
- Bazı direnç mekanizmaları düşük seviyelerde veya sadece indüksiyon altında ifade edildiğinden, fenotipik tarama bunları gözden kaçırabilir, bu da hangi doğrulayıcı stratejinin yeterli duyarlılık sağladığına dair soruları gündeme getirmektedir.
İlgili konular
Temel eserler
- paterson-2005
- nordmann-2009
- van-der-zwaluw-2015
Sıkça sorulan sorular
- Bir ESBL doğrulayıcı testi neyi göstermektedir?
- Bir beta-laktamaz inhibitörü eklemenin, organizmanın bir indikatör sefalosporine karşı duyarlılığını geri kazandırdığını göstermektedir, bu da geniş spektrumlu bir beta-laktamaz üretimini işaret etmektedir; spesifik enzimi adlandırmak yerine işlevsel mekanizmayı göstermektedir.
- Moleküler testler mevcutken karbapenemazlar neden fenotipik olarak tespit edilmektedir?
- Karbapenem inaktivasyon yöntemi gibi fenotipik testler ucuzdur ve spesifik genden bağımsız olarak işlevsel karbapenem hidrolize edici aktiviteyi tespit etmektedir; bu testler, bilinen genleri hedefleyen ancak yeni genleri gözden kaçırabilecek moleküler testleri tamamlamaktadır.