Antimikrobiyal Direncin Tespiti ve Karakterizasyonu
Antimikrobiyal direncin tespiti ve karakterizasyonu, bir mikroorganizmanın antimikrobiyal ajanlara duyarlı mı yoksa dirençli mi olduğunu belirlemek ve sorumlu mekanizmaları tanımlamakla ilgilenen tanısal mikrobiyolojinin bir alanıdır. Bu alan, ilacın varlığında büyümeyi ölçen fenotipik yöntemleri, belirli direnç fenotiplerini işaret eden hedefe yönelik testleri ve altta yatan direnç genlerini ve mutasyonlarını tespit eden moleküler yöntemleri kapsamaktadır.
Tanım
Bir organizmanın antimikrobiyal ajanlara yanıtının ve herhangi bir azalmış duyarlılığın altında yatan genetik ve biyokimyasal mekanizmalarının, standartlaştırılmış kırılma noktalarına göre yorumlanan fenotipik ve moleküler yöntemler kullanılarak sistematik laboratuvar belirlemesidir.
Kapsam
Bu alan, okuyucuyu üç tamamlayıcı yaklaşıma yönlendirmektedir: duyarlı-orta-dirençli yorumu sağlayan standartlaştırılmış antimikrobiyal duyarlılık testleri; beta-laktamaz üretimi gibi klinik olarak önemli direnç paternlerinin fenotipik tespiti; ve direnç belirleyicilerinin moleküler tespiti. Laboratuvarların hasta bakımı, sürveyans ve antimikrobiyal yönetişimde kullanılan duyarlılık verilerini nasıl ürettiğini çerçevelemekte olup, tedavi talimatları sunmamaktadır.
Alt konular
Temel sorular
- Bu organizma belirli bir antimikrobiyal ajana duyarlı mı yoksa dirençli mi ve bu değerlendirme nasıl standartlaştırılmaktadır?
- Hangi direnç fenotipi mevcuttur ve bunu hangi mekanizma açıklamaktadır?
- Hangi direnç genleri veya mutasyonları tespit edilebilir ve genotip ile fenotip arasındaki ilişki nasıldır?
Anahtar kavramlar
- Minimum İnhibitör Konsantrasyon (MİK)
- Klinik kırılma noktaları ve D-O-D (Duyarlı-Orta-Dirençli) yorumu
- Fenotipik ve genotipik tespit
- Beta-laktamaz ve karbapenemaz üretimi
- Kazanılmış direnç genleri ve kromozomal mutasyonlar
- Genotip-fenotip uyumu
- Standardizasyon (CLSI, EUCAST)
Mekanizmalar
Fenotipik yöntemler, organizmanın standartlaştırılmış bir inokülümünü tanımlanmış antimikrobiyal konsantrasyonlara maruz bırakmakta ve büyüme inhibisyonunu okumaktadır. Bu, bir MİK veya zon çapı olarak özetlenmekte ve CLSI ve EUCAST gibi standart kuruluşlar tarafından belirlenen kırılma noktalarına göre yorumlanmaktadır (jorgensen-2009; clsi-m100). Hedefe yönelik fenotipik testler, örneğin bir beta-laktamın beta-laktamaz tarafından hidrolizi gibi belirli bir direnç özelliğini tespit etmektedir. Moleküler yöntemler ise genetik belirleyiciyi doğrudan tespit etmekte, kazanılmış direnç genlerini veya dirençle ilişkili mutasyonları tanımlamaktadır; tüm genom dizilemesi (whole-genome sequencing) giderek daha kapsamlı karakterizasyona olanak tanımakla birlikte, genotip-fenotip tahmini kusurlu kalmaktadır (ellington-2017). Uzman kurallar, yorumlamayı iyileştirmek ve tutarsız sonuçları işaretlemek için mekanizmalar ile beklenen duyarlılık arasındaki bilinen ilişkileri kodlamaktadır (leclercq-2013).
Klinik önem
Duyarlılık ve direnç karakterizasyonu, enfeksiyon hastalıkları yönetimi, antimikrobiyal yönetişim, enfeksiyon kontrolü ve direnç sürveyansında kullanılan kanıtların temelini oluşturmaktadır. Bir referans alanı olarak, laboratuvarların bu verileri nasıl ürettiğini ve yorumladığını açıklamakta; bireysel hastalar için tanısal veya reçeteleme rehberliği sağlamamaktadır.
Epidemiyoloji
Standartlaştırılmış duyarlılık testleri ve direnç karakterizasyonu, yerel antibiyogramları ve ulusal ve uluslararası sürveyans sistemlerini besleyen verileri üretmektedir; bu sistemler, dirençli organizmaların ve direnç mekanizmalarının zaman içindeki ortaya çıkışını ve yayılımını takip etmektedir.
Tarihçe
Antimikrobiyal duyarlılık testleri, yirminci yüzyılın ortalarındaki antibiyotik çağıyla birlikte gelişmiştir. Difüzyon ve dilüsyon yöntemleri, CLSI ve EUCAST gibi kuruluşlar aracılığıyla standartlaştırılmıştır. Sonraki on yıllarda, bu alana ortaya çıkan direnç mekanizmaları için hedefe yönelik fenotipik testler eklenmiş ve daha yakın zamanda, direnç belirleyicilerinin moleküler ve dizileme tabanlı tespiti de dahil olmuştur (jorgensen-2009; ellington-2017).
Tartışmalar
- Genotip fenotipin yerini ne ölçüde alabilir?
- Moleküler ve dizileme yöntemleri direnç belirleyicilerini hızlı bir şekilde tespit etmekle birlikte, fenotipi her zaman güvenilir bir şekilde tahmin edememektedir; genotipik tahminin fenotipik duyarlılık testinin yerini ne ölçüde alabileceği aktif bir soru olmaya devam etmektedir.
İlgili konular
Temel eserler
- jorgensen-2009
- leclercq-2013
- ellington-2017
Sıkça sorulan sorular
- Direnci fenotipik ve moleküler olarak tespit etmek arasındaki fark nedir?
- Fenotipik yöntemler, organizmanın bir ilacın varlığında büyüyüp büyümediğini veya belirli bir direnç özelliğini ifade edip etmediğini gözlemlemektedir. Moleküler yöntemler ise direnç genini veya mutasyonu doğrudan tespit etmektedir; bu iki yöntem tamamlayıcı nitelikte olup her zaman uyumlu sonuçlar vermeyebilir.
- Neden standartlaştırılmış kırılma noktalarına ihtiyaç duyulmaktadır?
- CLSI ve EUCAST gibi standart kuruluşlardan gelen kırılma noktaları, ölçülen bir MİK veya zon çapını duyarlı, orta veya dirençli bir kategoriye dönüştürmektedir; böylece sonuçlar laboratuvarlar arasında karşılaştırılabilir olmaktadır.