ScholarGate
ผู้ช่วย

เปรียบเทียบวิธี

ดูวิธีที่เลือกเทียบกันแบบเคียงข้าง แถวที่ต่างกันจะถูกเน้นไว้

Bayesian Copy Number Variation Analysis×การวิเคราะห์ความแปรผันของจำนวนสำเนาในเซลล์เดี่ยว×
สาขาวิชาชีวสารสนเทศศาสตร์ชีวสารสนเทศศาสตร์
ตระกูลProcess / pipelineProcess / pipeline
ปีกำเนิด2004–20072011–2015
ผู้ริเริ่มColella et al. (QuantiSNP); Fridlyand et al. (HMM-based Bayesian CNV)Navin et al. (single-cell sequencing for CNV); Garvin et al. (Ginkgo tool, 2015)
ประเภทProbabilistic genomic analysis pipelineComputational genomics pipeline
แหล่งต้นตำรับColella, S., Yau, C., Taylor, J. M., Mirza, G., Butler, H., Clouston, P., Bassett, A. S., Seller, A., Holmes, C. C., & Ragoussis, J. (2007). QuantiSNP: an Objective Bayes Hidden-Markov Model to detect and accurately map copy number variation using SNP genotyping data. Nucleic Acids Research, 35(6), 2013–2025. DOI ↗Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link ↗
ชื่อเรียกอื่นBayesian CNV analysis, Bayesian CNV calling, probabilistic CNV detection, Bayesian HMM-CNVscCNV analysis, single-cell CNV, scCNA analysis, single-cell copy number aberration analysis
ที่เกี่ยวข้อง66
สรุปBayesian copy number variation (CNV) analysis is a probabilistic framework for detecting genomic segments where an individual's DNA copy count deviates from the diploid norm. By placing prior distributions over copy-number states and updating them with array CGH, SNP array, or sequencing read-depth evidence, the approach yields posterior probabilities for each copy-number state along the genome, providing statistically principled uncertainty quantification that frequentist segmentation methods lack.Single-cell copy number variation (scCNV) analysis detects gains and losses of genomic segments within individual cells, enabling researchers to resolve intratumor heterogeneity, reconstruct clonal evolution, and distinguish malignant from normal cells at single-cell resolution. It can be applied to single-cell whole-genome sequencing data directly or inferred from read-depth signals in scRNA-seq or scATAC-seq experiments.
ScholarGateชุดข้อมูล
  1. v1
  2. 2 แหล่งอ้างอิง
  3. PUBLISHED
  1. v1
  2. 2 แหล่งอ้างอิง
  3. PUBLISHED

ไปที่หน้าค้นหา ดาวน์โหลดสไลด์

ScholarGateเปรียบเทียบวิธี: Bayesian Copy Number Variation Analysis · Single-cell Copy Number Variation Analysis. สืบค้นเมื่อ 2026-06-18 จาก https://scholargate.app/th/compare