Концептуальные основы биомедицинской и клинической информатики

Биомедицинская информатика обычно рассматривается как единая фундаментальная наука с приложениями, охватывающими диапазон от молекулярного уровня до целых популяций. В этой статье описывается эта организующая концептуальная основа: общие методы и концепции, лежащие в ее основе, прикладные подобласти, такие как биоинформатика, информатика изображений, клиническая информатика, информатика общественного здравоохранения и потребительская информатика, а также связанное понятие клинической информатики как определенной области практики.

Definition

Концептуальная основа биомедицинской информатики — это концептуальная организация дисциплины, в которой общее ядро теорий, методов и концепций для представления и обработки биомедицинских данных, информации и знаний поддерживает прикладные подобласти, различающиеся главным образом масштабом биологических сущностей, с которыми они работают: от молекул и клеток (биоинформатика) через ткани и органы (информатика изображений) до индивидуумов (клиническая информатика) и популяций (информатика общественного здравоохранения).

Scope

Тема охватывает концептуальные основы биомедицинской информатики, взаимосвязь между ее базовыми методами и прикладными подобластями, а также основное содержание, определяющее клиническую информатику как область практики. Это справочный материал, описывающий организацию данной области, а не техническую реализацию или клинические рекомендации.

Core questions

• Какие основные методы и концепции являются общими для всей биомедицинской информатики?
• Как прикладные подобласти отличаются друг от друга?
• Что определяет клиническую информатику как субспециальность и область практики?
• Как эта концептуальная основа связывает базовые методы информатики с прикладной работой в области здравоохранения?

Key concepts

• Общее методологическое ядро биомедицинской информатики
• Подобласти по биологическому масштабу: биоинформатика, информатика изображений, клиническая информатика, информатика общественного здравоохранения, потребительская информатика
• Трансляционный спектр от молекулы до популяции
• Клиническая информатика как определенная субспециальность
• Основные компетенции для последипломного образования

Key theories

Фундаментальная теорема биомедицинской информатики

Предположение Фридмана о том, что информатика ценна в той степени, в какой человек, работающий с информационным ресурсом, достигает лучших результатов, чем тот же человек, работающий без него, что определяет дисциплину как расширяющую, а не заменяющую человеческое мышление.

Clinical relevance

Эта концептуальная основа помогает определить место любого данного инструмента или роли в информатике в рамках более широкой дисциплины и уточняет, что именно относится к практике клинической информатики. Это концептуальный справочный материал, который сам по себе не является руководством по клиническому лечению.

Evidence & guidelines

Документы профессионального консенсуса определяют биомедицинскую информатику и ее основные компетенции (Kulikowski et al., 2012), а также основное содержание субспециальности клинической информатики (Gardner et al., 2009); широко используемый справочный учебник подробно описывает ту же концептуальную основу (Shortliffe & Cimino, 2014).

History

По мере развития биомедицинской информатики ученые стремились к унифицированному объяснению того, почему ее разнообразные приложения принадлежат к одной дисциплине. Фридман сформулировал «фундаментальную теорему», определяющую информатику как расширение возможностей человека, совет AMIA определил основные компетенции для этой дисциплины, а сообщество клинической информатики определило основное содержание, лежащее в основе ее признания в качестве медицинской субспециальности (Friedman, 2009; Kulikowski et al., 2012; Gardner et al., 2009).

Debates

Является ли биомедицинская информатика единой дисциплиной или федерацией подобластей?

Сторонники унифицированной концептуальной основы утверждают, что общее методологическое ядро связывает биоинформатику с информатикой общественного здравоохранения, в то время как другие подчеркивают, что подобласти имеют различные данные, сообщества и методы; зонтичная концепция является влиятельной, но не общепринятой.

Key figures

• Charles P. Friedman
• Edward H. Shortliffe
• Casimir A. Kulikowski
• Reed M. Gardner

Seminal works

• friedman-2009
• kulikowski-2012
• gardner-2009

Frequently asked questions

В чем разница между биоинформатикой и клинической информатикой?

Обе имеют общее методологическое ядро, но различаются по биологическому масштабу, с которым они работают: биоинформатика работает с молекулярными и геномными данными, в то время как клиническая информатика применяет методы информатики для ухода за отдельными пациентами в рамках систем здравоохранения.

Что такое «фундаментальная теорема» биомедицинской информатики?

Это предположение Фридмана о том, что информационный ресурс ценен, когда человек, использующий его, достигает лучших результатов, чем тот же человек, работающий без него, что подчеркивает, что информатика должна расширять человеческое мышление.