Intervalo Serial e Tempo de Geração

O tempo de geração é o intervalo entre a infeção de um caso primário e a infeção dos casos secundários que este causa, enquanto o intervalo serial é o intervalo entre o início dos sintomas num caso primário e nos seus casos secundários. Como os tempos de infeção são geralmente não observados, o intervalo serial é o que a vigilância pode medir e é usado como um substituto prático para o tempo de geração; ambas as quantidades conectam o momento da transmissão à estimativa da velocidade de propagação de uma doença.

Definition

O tempo de geração é o tempo entre a infeção de um caso e a infeção das pessoas que este infeta; o intervalo serial é o tempo entre o início dos sintomas num caso e o início dos sintomas nas pessoas que este infeta, usado como um substituto observável para o tempo de geração.

Scope

Esta entrada distingue o tempo de geração do intervalo serial, explica como cada um se relaciona com os períodos de incubação e infeccioso, e descreve como estas medidas de tempo ligam a taxa de crescimento epidémico ao número de reprodução. É um tópico de referência metodológica, não uma orientação clínica.

Core questions

• Como o tempo de geração e o intervalo serial diferem, e por que a distinção é importante?
• Como esses intervalos se relacionam com o período de incubação e o período infeccioso?
• Como a distribuição do intervalo serial é usada para estimar o número de reprodução?
• Por que o tempo de geração é geralmente estimado em vez de observado diretamente?

Key concepts

• Tempo de geração (intervalo de geração)
• Intervalo serial
• Período de incubação
• Períodos latente e infeccioso
• Distribuição do intervalo serial
• Taxa de crescimento epidémico
• Estimativa do número de reprodução a partir do tempo

Key theories

Intervalo de geração e a relação taxa de crescimento-R

Wallinga e Lipsitch mostraram que a forma da distribuição do intervalo de geração determina como uma taxa de crescimento epidémico observada se traduz num número de reprodução, portanto, as medidas de tempo são essenciais para interpretar a transmissibilidade.

Mechanisms

O momento da transmissão é construído a partir da história natural da infeção: após a infeção, há um período latente antes que um hospedeiro se torne infeccioso e um período de incubação antes que os sintomas apareçam, e o hospedeiro transmite durante o seu período infeccioso. O tempo de geração mede infeção-a-infeção, enquanto o intervalo serial mede início-a-início; os dois coincidem em média sob algumas suposições, mas diferem na variância. Como os tempos de infeção são raramente observados, os analistas usam a distribuição do intervalo serial, juntamente com a taxa de crescimento epidémico, para estimar o número de reprodução, incluindo métodos que recuperam probabilidades de quem-infetou-quem ou números de reprodução variáveis no tempo a partir de dados de início de caso.

Clinical relevance

As medidas de tempo permitem que os analistas convertam curvas de casos observadas em estimativas de transmissibilidade e avaliem a rapidez com que um surto está a crescer. São quantidades de referência que descrevem o processo de transmissão e a geração de estimativas epidemiológicas, não uma base para decisões individuais de diagnóstico ou tratamento.

Epidemiology

Os intervalos seriais e tempos de geração estimados variam por patógeno e são influenciados por medidas de controlo que truncam o período infeccioso; revisões dos períodos de incubação para vírus respiratórios ilustram como o tempo da história natural difere entre agentes, e as análises de SARS usaram dados de início para estimar a transmissibilidade. Os intervalos relatados são, portanto, específicos do patógeno e do contexto.

History

A ideia do intervalo entre casos sucessivos é antiga na epidemiologia e foi clarificada pela descrição de Fine que distinguia o intervalo serial do tempo de transmissão subjacente. Nos anos 2000, o trabalho de Wallinga e colegas formalizou o papel do intervalo de geração na ligação das taxas de crescimento aos números de reprodução e desenvolveu métodos práticos de estimativa usando dados de início, com estruturas baseadas em software posteriores para números de reprodução variáveis no tempo.

Debates

O intervalo serial pode substituir com segurança o tempo de geração?

O intervalo serial é observável, mas pode diferir do intervalo de geração na variância e pode até ser negativo quando ocorre transmissão pré-sintomática, portanto, usá-lo como um substituto pode enviesar as estimativas do número de reprodução, a menos que a diferença seja contabilizada.

Key figures

• Jacco Wallinga
• Marc Lipsitch
• Paul Fine
• Anne Cori
• Justin Lessler

Seminal works

• wallinga-lipsitch-2007
• wallinga-teunis-2004
• fine-2003

Frequently asked questions

Qual é a diferença entre o intervalo serial e o tempo de geração?

O tempo de geração é medido entre eventos de infeção, enquanto o intervalo serial é medido entre os tempos de início dos sintomas; o intervalo serial é observável e é usado como um substituto porque os tempos de infeção geralmente não são conhecidos.

Por que esses intervalos são usados para estimar o número de reprodução?

A distribuição do tempo entre infeções sucessivas liga a taxa de crescimento epidémico observada ao número de casos secundários por caso, sendo, portanto, necessária para traduzir a rapidez com que os casos aumentam num número de reprodução.