Analiza zmienności liczby kopii w pojedynczych komórkach
Analiza zmienności liczby kopii w pojedynczych komórkach (scCNV) wykrywa zyski i straty segmentów genomowych w obrębie pojedynczych komórek, umożliwiając badaczom rozwikłanie heterogeniczności wewnątrz guza, rekonstrukcję ewolucji klonalnej oraz odróżnienie komórek złośliwych od normalnych z rozdzielczością pojedynczej komórki. Może być stosowana bezpośrednio do danych sekwencjonowania całego genomu z pojedynczych komórek lub wnioskowana z sygnałów głębokości odczytów w eksperymentach scRNA-seq lub scATAC-seq.
Przeczytaj pełny opis metody
Zaloguj się na bezpłatne konto, aby przeczytać tę sekcję.
Mapa metod
Sąsiedztwo pokrewnych metod — wybierz węzeł, aby je zgłębić.
Źródła
- Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link ↗
- Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. link ↗
Jak cytować tę stronę
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/pl/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis
Która metoda?
Zestaw tę metodę z najbliższymi jej krewnymi i czytaj je obok siebie — biblioteka kładzie księgi na stole; wybór należy do Ciebie.
- Analiza zmienności liczby kopiiBioinformatyka↔ porównaj
- Badanie asocjacyjne epigenomu w pojedynczych komórkach (scEWAS)Bioinformatyka↔ porównaj
- Single-cell GWASBioinformatyka↔ porównaj
- Analiza scRNA-seq pojedynczych komórekBioinformatyka↔ porównaj
- Single-cell RNA-seq differential expressionBioinformatyka↔ porównaj
- WariantyBioinformatyka↔ porównaj
Cytowana przez
Widzisz błąd na tej stronie? Zgłoś go lub zaproponuj poprawkę →