Bayesowska analiza liczby kopii
Bayesowska analiza liczby kopii (CNV) to probabilistyczny model służący do wykrywania segmentów genomu, w których liczba kopii DNA osobnika odbiega od normy diploidalnej. Poprzez umieszczenie rozkładów a priori na stanach liczby kopii i ich aktualizację na podstawie danych z array CGH, SNP array lub sekwencjonowania z analizą głębokości odczytu, podejście to generuje prawdopodobieństwa a posteriori dla każdego stanu liczby kopii w genomie, zapewniając statystycznie uzasadnioną kwantyfikację niepewności, której brakuje w częstotliwościowych metodach segmentacji.
Przeczytaj pełny opis metody
Zaloguj się na bezpłatne konto, aby przeczytać tę sekcję.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Źródła
- Colella, S., Yau, C., Taylor, J. M., Mirza, G., Butler, H., Clouston, P., Bassett, A. S., Seller, A., Holmes, C. C., & Ragoussis, J. (2007). QuantiSNP: an Objective Bayes Hidden-Markov Model to detect and accurately map copy number variation using SNP genotyping data. Nucleic Acids Research, 35(6), 2013–2025. DOI: 10.1093/nar/gkm076 ↗
- Fridlyand, J., Snijders, A. M., Pinkel, D., Albertson, D. G., & Jain, A. N. (2004). Hidden Markov models approach to the analysis of array CGH data. Journal of Multivariate Analysis, 90(1), 132–153. DOI: 10.1016/j.jmva.2004.02.008 ↗
Jak cytować tę stronę
ScholarGate. (2026, June 3). Bayesian Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/pl/bioinformatics/bayesian-copy-number-variation-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Bayesian GWASBioinformatyka↔ compare
- Bayesian Variant CallingBioinformatyka↔ compare
- Analiza zmienności liczby kopiiBioinformatyka↔ compare
- Badanie asocjacyjne całego genomu (GWAS)Bioinformatyka↔ compare
- Analiza zmienności liczby kopii w pojedynczych komórkachBioinformatyka↔ compare
- WariantyBioinformatyka↔ compare
Widzisz błąd na tej stronie? Zgłoś go lub zaproponuj poprawkę →