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Single-cell Copy Number Variation Analysis/증거
방법 증거 기록

Single-cell Copy Number Variation Analysis

Single-cell copy number variation (scCNV) analysis detects gains and losses of genomic segments within individual cells, enabling researchers to resolve intratumor heterogeneity, reconstruct clonal evolution, and distinguish malignant from normal cells at single-cell resolution. It can be applied to single-cell whole-genome sequencing data directly or inferred from read-depth signals in scRNA-seq or scATAC-seq experiments.

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원본 기록

방법의 원본 기록에서 그대로 복사된 인용입니다. 이로부터 수준별 검증이 추론되지 않습니다.

Single-cell Copy Number Variation Analysis
분류학적 방법 기록 · process-pipeline / bioinformatics
  • Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. · URL
  • Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. · URL
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큐레이션된 주장

각각 자체 평가와 함께 증거 원장에 유지된 주장입니다.

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관련 방법

방법 그래프에서 생성되었으며 기계가 제안한 관계로 표시됩니다 — 증거 주장이 추론되지 않습니다.

Taxonomic bucketCopy Number Variation Analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketSingle-cell epigenome-wide association studymachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketSingle-cell GWASmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketSingle-cell RNA-seq analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketSingle-cell RNA-seq differential expressionmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketVariant Callingmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.

증거 상태

Sources recorded, not reviewed

Bibliographic sources are present. Claim-level evidence review has not been performed.

출처

방법 원본 기록에서 복사된 기록된 인용 2개.

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