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ChIP-seq Peak Calling — 크로마틴 면역침강 시퀀싱 피크 호출

ChIP-seq 피크 호출은 크로마틴 면역침강 실험의 시퀀싱 리드를 기반으로 관심 단백질(전사 인자 또는 히스톤 변형)이 풍부한 유전체 영역을 식별하는 계산 파이프라인입니다. 이는 원시 시퀀싱 데이터를 유전체 전반에 걸쳐 고신뢰성 결합 또는 변형 부위 집합으로 변환하여 유전자 조절, 크로마틴 상태 및 후성유전학적 메커니즘의 후속 분석을 가능하게 합니다.

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ChIP-seq Peak Calling

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출처

Zhang, Y., Liu, T., Meyer, C. A., Eeckhoute, J., Johnson, D. S., Bernstein, B. E., Nusbaum, C., Myers, R. M., Brown, M., Li, W., & Liu, X. S. (2008). Model-based analysis of ChIP-seq (MACS). Genome Biology, 9(9), R137. DOI: 10.1186/gb-2008-9-9-r137 ↗
Landt, S. G., Marinov, G. K., Kundaje, A., Kheradpour, P., Pauli, F., Batzoglou, S., Bernstein, B. E., Bickel, P., Brown, J. B., Cayting, P., Chen, Y., DeSalvo, G., Epstein, C., Fisher-Aylor, K. I., Euskirchen, G., Gerstein, M., Gertz, J., Hartemink, A. J., Hoffman, M. M., ... Snyder, M. (2012). ChIP-seq guidelines and practices of the ENCODE and modENCODE consortia. Genome Research, 22(9), 1813–1831. DOI: 10.1101/gr.136184.111 ↗

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ScholarGate. (2026, June 3). Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/ko/bioinformatics/chip-seq-peak-calling

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