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Time-series ChIP-seq Peak Calling — Temporal Chromatin Profiling
Time-series ChIP-seq peak calling은 표준 ChIP-seq 분석을 여러 시점에서 수집된 샘플로 확장하는 것입니다. 시간적 차원에서 단백질-DNA 결합 피크를 식별하고 비교함으로써, 이 방법은 전사 인자 점유율, 히스톤 변형 또는 염색질 리모델러 결합이 분화, 일주기 주기 또는 자극 반응과 같은 생물학적 과정 동안 어떻게 진화하는지를 밝혀냅니다.
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출처
- Landt, S. G., Marinov, G. K., Kundaje, A., Kheradpour, P., Pauli, F., Batzoglou, S., ... & Snyder, M. (2012). ChIP-seq guidelines and practices of the ENCODE and modENCODE consortia. Genome Research, 22(9), 1813–1831. DOI: 10.1101/gr.136184.111 ↗
- Haiminen, N., Karlebach, G., Kharchenko, P. V., & Lähdesmäki, H. (2018). TimeChIP: time-series peak calling for ChIP-seq data. Bioinformatics, 34(24), 4161–4167. link ↗
이 페이지 인용 방법
ScholarGate. (2026, June 3). Time-series Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/ko/bioinformatics/time-series-chip-seq-peak-calling
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