ATAC-seq 분석
ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing)는 유전체 전반에 걸쳐 염색질 접근성(chromatin accessibility)의 지형을 프로파일링하는 방법이다. 2013년 Buenrostro와 동료들이 개발한 ATAC-seq는 고활성 전위효소(hyperactive transposase)를 사용하여 개방되고 접근 가능한 염색질 영역에 표지를 부착함으로써 조절 DNA 요소(regulatory DNA elements)를 빠르고 민감하게 식별할 수 있게 한다. ATAC-seq는 유전자 조절 지형을 특성화하고, 세포 유형 특이적 조절 요소를 발견하며, 유전자 조절 네트워크를 추론하는 표준 기술이 되었다.
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출처
- Buenrostro, J. D., Giresi, P. G., Zaba, L. C., Chang, H. Y., & Greenleaf, W. J. (2013). Transposition of native chromatin for fast and sensitive epigenomic profiling of cell populations and tissues. Nature Methods, 10(12), 1213–1218. link ↗
- Corces, M. R., Buenrostro, J. D., Wu, B., Greenside, P. G., Chan, S. M., Koenig, J. L., & Greenleaf, W. J. (2017). Lineage-specific and single-cell chromatin accessibility charts human hematopoiesis. Nature Genetics, 48(10), 1193–1203. DOI: 10.1038/ng.3646 ↗
- Satpathy, A. T., Granja, J. M., Yost, K. E., Qi, Y., Meschi, F., McDermott, G. P., & Chang, H. Y. (2019). Massively parallel single-cell chromatin landscapes. Nature Biotechnology, 37(12), 1452–1462. link ↗
이 페이지 인용 방법
ScholarGate. (2026, June 3). ATAC-seq Analysis for Chromatin Accessibility and Regulatory Landscapes. ScholarGate. https://scholargate.app/ko/genetics/atac-seq-analysis
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